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Cancer biomarkers : section A of Disease markers2023Sep02Vol.issue()

肺腺癌におけるリボソーム生合成および免疫細胞浸潤におけるHSPD1と調節不全の潜在的な関連:統合されたバイオインフォマティックアプローチ

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

背景:肺腺癌(LUAD)は、世界中の死亡率が高い肺がんの主要な組織学的サブタイプです。熱ショックタンパク質ファミリーDメンバー1(HSPD1、HSP60とも呼ばれる)は、健康なコントロール組織と比較して肺がん患者の腫瘍組織で増加することが報告されています。 目的:統合的なバイオインフォマティック分析を使用して、LUADにおける予後、発がん、および免疫浸潤におけるHSPD1の役割を調査することを目指しました。 方法:LUADにおけるHSPD1発現は、いくつかのトランスクリプトームベースおよびタンパク質データベースで調査されました。KMプロッターとOslucaデータベースを使用して生存分析を実施しましたが、予後的意義は単変量および多変量解析を通じて独立して確認されました。HSPD1相関遺伝子の統合遺伝子相互作用ネットワークと濃縮分析を実行して、LUAD発がんにおけるHSPD1の役割を調査しました。タイマーとTisIDBを使用して、HSPD1発現と免疫細胞浸潤との相関を分析しました。 結果:HSPD1のmRNAおよびタンパク質発現は、正常組織と比較してLUADで高かった。高いHSPD1発現は、男性の性別に関連し、LUADは高度な段階で関連していました。高いHSPD1発現は、LUAD患者の生存率が低いことに関連する独立した予後因子でした。予後衝撃のHSPD1相関遺伝子は、主に異常なリボソーム生合成に関与していましたが、HSPD1発現が高いLuad患者は、活性化および未熟B細胞およびCD4+ T細胞の腫瘍浸潤が低かった。 結論:HSPD1は、LUADのリボソーム生合成とB細胞媒介免疫の調節に役割を果たす可能性があります。LUADでの予後および免疫療法反応の予測バイオマーカーとして機能する可能性があります。

背景:肺腺癌(LUAD)は、世界中の死亡率が高い肺がんの主要な組織学的サブタイプです。熱ショックタンパク質ファミリーDメンバー1(HSPD1、HSP60とも呼ばれる)は、健康なコントロール組織と比較して肺がん患者の腫瘍組織で増加することが報告されています。 目的:統合的なバイオインフォマティック分析を使用して、LUADにおける予後、発がん、および免疫浸潤におけるHSPD1の役割を調査することを目指しました。 方法:LUADにおけるHSPD1発現は、いくつかのトランスクリプトームベースおよびタンパク質データベースで調査されました。KMプロッターとOslucaデータベースを使用して生存分析を実施しましたが、予後的意義は単変量および多変量解析を通じて独立して確認されました。HSPD1相関遺伝子の統合遺伝子相互作用ネットワークと濃縮分析を実行して、LUAD発がんにおけるHSPD1の役割を調査しました。タイマーとTisIDBを使用して、HSPD1発現と免疫細胞浸潤との相関を分析しました。 結果:HSPD1のmRNAおよびタンパク質発現は、正常組織と比較してLUADで高かった。高いHSPD1発現は、男性の性別に関連し、LUADは高度な段階で関連していました。高いHSPD1発現は、LUAD患者の生存率が低いことに関連する独立した予後因子でした。予後衝撃のHSPD1相関遺伝子は、主に異常なリボソーム生合成に関与していましたが、HSPD1発現が高いLuad患者は、活性化および未熟B細胞およびCD4+ T細胞の腫瘍浸潤が低かった。 結論:HSPD1は、LUADのリボソーム生合成とB細胞媒介免疫の調節に役割を果たす可能性があります。LUADでの予後および免疫療法反応の予測バイオマーカーとして機能する可能性があります。

BACKGROUND: Lung adenocarcinoma (LUAD) is a major histological subtype of lung cancer with a high mortality rate worldwide. Heat shock protein family D member 1 (HSPD1, also known as HSP60) is reported to be increased in tumor tissues of lung cancer patients compared with healthy control tissues. OBJECTIVE: We aimed to investigate the roles of HSPD1 in prognosis, carcinogenesis, and immune infiltration in LUAD using an integrative bioinformatic analysis. METHODS: HSPD1 expression in LUAD was investigated in several transcriptome-based and protein databases. Survival analysis was performed using the KM plotter and OSluca databases, while prognostic significance was independently confirmed through univariate and multivariate analyses. Integrative gene interaction network and enrichment analyses of HSPD1-correlated genes were performed to investigate the roles of HSPD1 in LUAD carcinogenesis. TIMER and TISIDB were used to analyze correlation between HSPD1 expression and immune cell infiltration. RESULTS: The mRNA and protein expressions of HSPD1 were higher in LUAD compared with normal tissues. High HSPD1 expression was associated with male gender and LUAD with advanced stages. High HSPD1 expression was an independent prognostic factor associated with poor survival in LUAD patients. HSPD1-correlated genes with prognostic impact were mainly involved in aberrant ribosome biogenesis, while LUAD patients with high HSPD1 expression had low tumor infiltrations of activated and immature B cells and CD4+ T cells. CONCLUSIONS: HSPD1 may play a role in the regulation of ribosome biogenesis and B cell-mediated immunity in LUAD. It could serve as a predictive biomarker for prognosis and immunotherapy response in LUAD.

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