プロットが厚くなります：レタリアの半数体と三倍体のようなタリ、ハイブリダイゼーション、バイアス材の型比率

地衣類の真菌共生生物の生殖生物学の研究は、彼らの複雑なライフスタイルのために伝統的に挑戦的でした。Haploidyの一般的な信念に対して、最近のゲノム研究では、レタリアで三倍体のようなシグナルが発見されました。ここでは、純粋な培養およびタリからゲノムデータを分析し、天然集団におけるMAT遺伝子座のPCR調査を実施することにより、レタリアのゲノム組織と生殖を推測します。L. lupinaの単一の性的胞子に由来する純粋な培養を含む4つのレタリア標本の読み取りカウント変動は、半数体と一致していることがわかりました。対照的に、L。lupinaの読み取りは、Thallusのメタゲノムからカウントを3倍体のようにしています。交配型遺伝子座の特性評価により、属全体にわたって保存されたヘテロタリック構成と、我々が特定した補助遺伝子が明らかになりました。L. vulpinaとL. lupinaについては、併用型分布が北米でバランスが取れていることがわかりました。まとめると、レタリア菌はヘテロタリティックで通常半数体であることを提案し、三倍体のような個人がL. lupinaと未知のレタリア系統の間のハイブリッドであるという証拠を提供し、最近のゲノム観察と古典的な系統的および遺伝的研究を調整します。

The study of the reproductive biology of lichen fungal symbionts has been traditionally challenging due to their complex lifestyles. Against the common belief of haploidy, a recent genomic study found a triploid-like signal in Letharia. Here, we infer the genome organization and reproduction in Letharia by analyzing genomic data from a pure culture and from thalli, and performing a PCR survey of the MAT locus in natural populations. We found that the read count variation in the four Letharia specimens, including the pure culture derived from a single sexual spore of L. lupina, is consistent with haploidy. By contrast, the L. lupina read counts from a thallus' metagenome are triploid-like. Characterization of the mating-type locus revealed a conserved heterothallic configuration across the genus, along with auxiliary genes that we identified. We found that the mating-type distributions are balanced in North America for L. vulpina and L. lupina, suggesting widespread sexual reproduction, but highly skewed in Europe for L. vulpina, consistent with predominant asexuality. Taken together, we propose that Letharia fungi are heterothallic and typically haploid, and provide evidence that triploid-like individuals are hybrids between L. lupina and an unknown Letharia lineage, reconciling classic systematic and genetic studies with recent genomic observations.