全ゲノムシーケンスからのマップされていない短い読み取りは、ドイツの黒いパイド牛の潜在的な感染性病原体を示しています

動物のゲノムを回避する場合、いくつかの短い読み取りは参照ゲノムにマッピングすることはできず、通常は破棄されます。この研究では、潜在的な病原性DNAを特定するために、302ドイツの黒いパイド牛からのマップされていない読み取りを分析しました。これらのマップされていない読み取りは、NCBIのデータベースに対して組み立てられ、爆破されて、細菌およびウイルスの配列を識別しました。結果は、病原体の存在に関する証拠を提供しました。ウシパルボウイルス3とマイコプラズマ種のシーケンスを見つけました。これらの発見は、獣医や疫学者にとって重要な細菌およびウイルス感染に関する洞察を得るためのマッピングされていない読み取りの情報内容を強調しています。

When resequencing animal genomes, some short reads cannot be mapped to the reference genome and are usually discarded. In this study, unmapped reads from 302 German Black Pied cattle were analyzed to identify potential pathogenic DNA. These unmapped reads were assembled and blasted against NCBI's database to identify bacterial and viral sequences. The results provided evidence for the presence of pathogens. We found sequences of Bovine parvovirus 3 and Mycoplasma species. These findings emphasize the information content of unmapped reads for gaining insight into bacterial and viral infections, which is important for veterinarians and epidemiologists.