著名医師による解説が無料で読めます
すると翻訳の精度が向上します
p53経路は腫瘍形成において重要です。ただし、膀胱癌（BLCA）におけるp53経路遺伝子の役割を具体的に調査する研究は行われていません。この研究では、がんゲノムアトラス（TCGA）の筋肉侵襲性膀胱癌患者（n = 411）のトランスクリプトミクスデータを調査しました。Hallmark P53経路遺伝子セットを使用して、非陰性マトリックス因数分解（NMF）分析により、2つのサブタイプ（C1およびC2）が特定されました。サブタイプの明確な特性を検証するために、臨床、生存、および免疫学的分析が行われました。経路濃縮分析では、予後不良のサブタイプC1が免疫関連経路の遺伝子を濃縮していることを示しました。ここで、予後が良好であるC2サブタイプがステロイド合成および薬物代謝経路の遺伝子に濃縮されています。MDGA2、GNLY、GGT2、UGT2B4、DLX1、およびDSC1からなるシグネチャー遺伝子セットが作成され、その後リスクモデルが作成されました。それらの発現は、血液から抽出されたRNAで分析され、BLCA患者の腫瘍組織と一致しました（n = 10）。DSC1は、BLCAサンプルの血液組織と腫瘍組織の間で発現の有意差（p = 0.005）を持っていました。通常の正常な膀胱組織と血液比とは異なり、DLX1の発現は、血液よりも腫瘍組織の方が低かった（p = 0.02734）。膀胱癌に設定されたp53経路関連の署名遺伝子の最初の研究であるこの研究は、BLCAのバイオマーカーの開発に大きな影響を与える可能性があります。
p53経路は腫瘍形成において重要です。ただし、膀胱癌（BLCA）におけるp53経路遺伝子の役割を具体的に調査する研究は行われていません。この研究では、がんゲノムアトラス（TCGA）の筋肉侵襲性膀胱癌患者（n = 411）のトランスクリプトミクスデータを調査しました。Hallmark P53経路遺伝子セットを使用して、非陰性マトリックス因数分解（NMF）分析により、2つのサブタイプ（C1およびC2）が特定されました。サブタイプの明確な特性を検証するために、臨床、生存、および免疫学的分析が行われました。経路濃縮分析では、予後不良のサブタイプC1が免疫関連経路の遺伝子を濃縮していることを示しました。ここで、予後が良好であるC2サブタイプがステロイド合成および薬物代謝経路の遺伝子に濃縮されています。MDGA2、GNLY、GGT2、UGT2B4、DLX1、およびDSC1からなるシグネチャー遺伝子セットが作成され、その後リスクモデルが作成されました。それらの発現は、血液から抽出されたRNAで分析され、BLCA患者の腫瘍組織と一致しました（n = 10）。DSC1は、BLCAサンプルの血液組織と腫瘍組織の間で発現の有意差（p = 0.005）を持っていました。通常の正常な膀胱組織と血液比とは異なり、DLX1の発現は、血液よりも腫瘍組織の方が低かった（p = 0.02734）。膀胱癌に設定されたp53経路関連の署名遺伝子の最初の研究であるこの研究は、BLCAのバイオマーカーの開発に大きな影響を与える可能性があります。
p53 pathway is important in tumorigenesis. However, no study has been performed to specifically investigate the role of p53 pathway genes in bladder cancer (BLCA). In this study, transcriptomics data of muscle invasive bladder cancer patients (n = 411) from The Cancer Genome Atlas (TCGA) were investigated. Using the hallmark p53 pathway gene set, the Non-Negative Matrix factorization (NMF) analysis identified two subtypes (C1 and C2). Clinical, survival, and immunological analysis were done to validate distinct characteristics of the subtypes. Pathway enrichment analysis showed the subtype C1 with poor prognosis having enrichment in genes of the immunity related pathways, where C2 subtype with better prognosis being enriched in genes of the steroid synthesis and drug metabolism pathways. A signature gene set consisting of MDGA2, GNLY, GGT2, UGT2B4, DLX1, and DSC1 was created followed by a risk model. Their expressions were analyzed in RNA extracted from the blood and matched tumor tissues of BLCA patients (n = 10). DSC1 had significant difference of expression (p = 0.005) between the blood and tumor tissues in our BLCA samples. Contrary to the usual normal bladder tissue to blood ratio, DLX1 expression was lower (p = 0.02734) in tumor tissues than in blood. Being the first research of p53 pathway related signature gene set in bladder cancer, this study potentially has a substantial impact on the development of biomarkers for BLCA.
医師のための臨床サポートサービス
ヒポクラ x マイナビのご紹介
無料会員登録していただくと、さらに便利で効率的な検索が可能になります。