LNCRNA RPPH1活性の阻害は、炎症関連の癌遺伝子のダウンレギュレーションにより腫瘍の増殖と転移を減少させます

目的：リボヌクレアーゼP RNA成分H1（RPPH1）は、がんの進行に関連する長い非コードRNA（LNCRNA）です。乳房および子宮頸がんのサンプルでは、LNCRNASNP2データベースを介して観察された乳がんサンプルよりも高いRPPH1発現が観察されました。したがって、RPPH1は転写RNA（TRNA）前駆体の処理に関与するリボヌクレアーゼPのRNAサブユニットでもあり、RPPH1ノックダウンの効果もまだ完全には理解されていないにもかかわらず、RPPH1発現をサイレンシングすることは癌治療の潜在的な戦略である可能性があります。 方法：各shRNAトランスフェクトRPPH1ノックダウンMDA-MB-231、RPPH1ノックダウンHELA細胞、およびそれぞれのコントロール細胞のRNAシーケンスにより、差次的に発現した遺伝子（DEGS）が同定されました。これらのdegに、MDA-MB-231およびHELA細胞におけるRPPH1サイレンシングの効果を検証するin vitroの実験により。 結果：RPPH1ノックダウンMDA-MB-231およびHELA細胞で数百のダウンレギュレートされたDEGが特定されましたが、バイオインフォマティクス分析により、これらの遺伝子は免疫応答と癌形成に関連する経路に関与していることが明らかになりました。模擬およびベクタートランスフェクトされた細胞と比較して、RPPH1サイレンティングヘラおよびMDA-MB-231細胞では、成熟したTRNA、細胞増殖、および移動能力の産生が阻害されました。さらに、RPPH1ノックダウンは、主にサイクリンD1のダウンレギュレーションを通じてG1細胞周期停止を促進しましたが、糖溶解経路はRPPH1ノックダウンヘラ細胞でのみ影響を受けましたが、MDA-MB-231細胞ではありませんでした。 結論：この研究は、ノックダウンRPPH1がTRNA産生、細胞増殖、および代謝に影響を与えることを実証しました。私たちの調査結果は、腫瘍の発達におけるRPPH1の役割に関する洞察を提供するかもしれません。

OBJECTIVE: Ribonuclease P RNA component H1 (RPPH1) is a long non-coding RNA (lncRNA) associated with cancer progression. Higher RPPH1 expression in breast and cervical cancer samples than that in normal tissues were observed through the lncRNASNP2 database; therefore, silencing RPPH1 expression might be a potential strategy for cancer treatments, even though RPPH1 is also an RNA subunit of ribonuclease P involved in processing transfer RNA (tRNA) precursors and the effect of RPPH1 knockdown is not yet fully understood. METHODS: Differentially expressed genes (DEGs) were identified through RNA sequencing in each shRNA-transfected RPPH1 knockdown MDA-MB-231, RPPH1 knockdown HeLa cell, and respective control cells, then the gene ontology enrichment analysis was performed by IPA and MetaCore database according to these DEGs, with further in vitro experiments validating the effect of RPPH1 silencing in MDA-MB-231 and HeLa cells. RESULTS: Hundreds of down-regulated DEGs were identified in RPPH1 knockdown MDA-MB-231 and HeLa cells while bioinformatics analysis revealed that these genes were involved in pathways related to immune response and cancerogenesis. Compared to mock- and vector-transfected cells, the production of mature tRNAs, cell proliferation and migration capacity were inhibited in RPPH1-silenced HeLa and MDA-MB-231 cells. Additionally, RPPH1 knockdown promoted G1 cell cycle arrest mainly through the down-regulation of cyclin D1, although glycolytic pathways were only affected in RPPH1 knockdown HeLa cells but not MDA-MB-231 cells. CONCLUSION: This study demonstrated that knockdown RPPH1 affected tRNA production, cell proliferation and metabolism. Our findings might provide insight into the role of RPPH1 in tumor development.