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Proceedings. Biological sciences2024Jan10Vol.291issue(2014)

ヨーロッパの納屋フクロウ(Tyto alba)の連続的な羽毛の色の変化のゲノムアーキテクチャ

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

野生集団における色の変動の維持は、長い間進化生物学者を魅了してきましたが、ほとんどの研究では、かなり単純な継承パターンと遺伝的建築を示す離散的な特性に焦点を当てています。しかし、連続した色の特性とその潜在的にオリゴまたは多遺伝子の遺伝的塩基の研究は、野生集団ではまれなままです。75人の全ゲノムデータに関するゲノムワイドな関連アプローチを使用して、ヨーロッパの納屋フクロウ(Tyto Alba)の連続的に変化する白からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨までの羽の色の遺伝学を研究しました。メラノコルチン-1-受容体遺伝子(MC1R)の変異が色に関与していることを確認し、スーパースコフェルド9と42に位置する2つの新しい領域を特定しました。、95%信頼できる間隔58.45-100%)。性染色体に位置する1つの発見された領域は、特定のMC1R遺伝子型を共有するフクロウの最も極端な色の間で異なります。この領域は、おそらく常染色体MC1Rとの相互作用において、この種の色性二形性において役割を果たす可能性があります。したがって、私たちは、連続した色の変動の遺伝的構造に関する洞察を提供し、遺伝子座の間で潜在的な結果的効果を備えたoligogenicの基礎を指し、将来の研究が自然に連続的に維持される方法を理解するのに役立つはずです。

野生集団における色の変動の維持は、長い間進化生物学者を魅了してきましたが、ほとんどの研究では、かなり単純な継承パターンと遺伝的建築を示す離散的な特性に焦点を当てています。しかし、連続した色の特性とその潜在的にオリゴまたは多遺伝子の遺伝的塩基の研究は、野生集団ではまれなままです。75人の全ゲノムデータに関するゲノムワイドな関連アプローチを使用して、ヨーロッパの納屋フクロウ(Tyto Alba)の連続的に変化する白からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨からru骨までの羽の色の遺伝学を研究しました。メラノコルチン-1-受容体遺伝子(MC1R)の変異が色に関与していることを確認し、スーパースコフェルド9と42に位置する2つの新しい領域を特定しました。、95%信頼できる間隔58.45-100%)。性染色体に位置する1つの発見された領域は、特定のMC1R遺伝子型を共有するフクロウの最も極端な色の間で異なります。この領域は、おそらく常染色体MC1Rとの相互作用において、この種の色性二形性において役割を果たす可能性があります。したがって、私たちは、連続した色の変動の遺伝的構造に関する洞察を提供し、遺伝子座の間で潜在的な結果的効果を備えたoligogenicの基礎を指し、将来の研究が自然に連続的に維持される方法を理解するのに役立つはずです。

The maintenance of colour variation in wild populations has long fascinated evolutionary biologists, although most studies have focused on discrete traits exhibiting rather simple inheritance patterns and genetic architectures. However, the study of continuous colour traits and their potentially oligo- or polygenic genetic bases remains rare in wild populations. We studied the genetics of the continuously varying white-to-rufous plumage coloration of the European barn owl (Tyto alba) using a genome-wide association approach on the whole-genome data of 75 individuals. We confirmed a mutation at the melanocortin-1-receptor gene (MC1R) is involved in the coloration and identified two new regions, located in super-scaffolds 9 and 42. The combination of the three regions explains most of the colour variation (80.37%, 95% credible interval 58.45-100%). One discovered region, located in the sex chromosome, differs between the most extreme colorations in owls sharing a specific MC1R genotype. This region may play a role in the colour sex dimorphism of this species, possibly in interaction with the autosomal MC1R. We thus provide insights into the genetic architecture of continuous colour variation, pointing to an oligogenic basis with potential epistatic effects among loci that should aid future studies understanding how continuous colour variation is maintained in nature.

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