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Computational and structural biotechnology journal20230101Vol.21issue()

透明細胞腎細胞癌の免疫細胞浸潤で機能するGBP2を伴う5タンパク性の予後署名

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

透明細胞腎細胞癌(CCRCC)は臨床転帰不良であり、現在は信頼できる予後バイオマーカーが欠けています。癌ゲノムアトラス(TCGA)と臨床プロテオーム腫瘍分析コンソーシアム(CPTAC)のデータセットを分析することにより、GBP2、HLA-DRA、ISG15、ISG20およびitGaxを含む5タンパク質の予後的特徴を確立しました。私たちのデータは、この署名がCCRCC患者の高度な段階、より高い病理学的グレード、および好ましくない生存と密接に相関していたことを示しています。さらに、機能的にGBP2を特徴付けました。GBP2の過剰発現により、STAT2とSTAT3のリン酸化が促進され、JAK-STATシグナル伝達をトリガーし、CCRCCの細胞移動と浸潤を促進しました。JAK/STATの特定の阻害剤であるルキソリチニブの治療は、GBP2を介した表現型を減衰させました。GBP2発現が高い患者には、CD3、CD8、CD68、および免疫チェックポイントマーカーPD-1およびCTLA4で陽性に染色された免疫細胞のより多くの浸潤が伴い、CCRCC組織のオパール多重免疫ヒストロイストリームによって検証されました。高GBP2を発現する患者では、より多くのCD8+T細胞とCD68+マクロファージが観察されました。まとめると、我々の研究では5タンパク質の予後署名が構築されました。GBP2は、JAK-STATシグナル伝達と腫瘍免疫浸潤を調節することにより発癌性の役割を果たしているため、CCRCCの潜在的な治療標的として機能する可能性があります。

透明細胞腎細胞癌(CCRCC)は臨床転帰不良であり、現在は信頼できる予後バイオマーカーが欠けています。癌ゲノムアトラス(TCGA)と臨床プロテオーム腫瘍分析コンソーシアム(CPTAC)のデータセットを分析することにより、GBP2、HLA-DRA、ISG15、ISG20およびitGaxを含む5タンパク質の予後的特徴を確立しました。私たちのデータは、この署名がCCRCC患者の高度な段階、より高い病理学的グレード、および好ましくない生存と密接に相関していたことを示しています。さらに、機能的にGBP2を特徴付けました。GBP2の過剰発現により、STAT2とSTAT3のリン酸化が促進され、JAK-STATシグナル伝達をトリガーし、CCRCCの細胞移動と浸潤を促進しました。JAK/STATの特定の阻害剤であるルキソリチニブの治療は、GBP2を介した表現型を減衰させました。GBP2発現が高い患者には、CD3、CD8、CD68、および免疫チェックポイントマーカーPD-1およびCTLA4で陽性に染色された免疫細胞のより多くの浸潤が伴い、CCRCC組織のオパール多重免疫ヒストロイストリームによって検証されました。高GBP2を発現する患者では、より多くのCD8+T細胞とCD68+マクロファージが観察されました。まとめると、我々の研究では5タンパク質の予後署名が構築されました。GBP2は、JAK-STATシグナル伝達と腫瘍免疫浸潤を調節することにより発癌性の役割を果たしているため、CCRCCの潜在的な治療標的として機能する可能性があります。

Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is of poor clinical outcomes, and currently lacks reliable prognostic biomarkers. By analyzing the datasets of the Cancer Genome Atlas (TCGA) and the Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC), we established a five-protein prognostic signature containing GBP2, HLA-DRA, ISG15, ISG20 and ITGAX. Our data indicate that this signature was closely correlated with advanced stage, higher pathological grade, and unfavorable survivals in patients with ccRCC. We further functionally characterized GBP2. Overexpression of GBP2 enhanced the phosphorylation of STAT2 and STAT3 to trigger JAK-STAT signaling and promote cell migration and invasion in ccRCC. Treatment of Ruxolitinib, a specific inhibitor of JAK/STAT, attenuated the GBP2-mediated phenotypes. Patients with high GBP2 expression were accompanied with more infiltration of immune cells positively stained with CD3, CD8, CD68, and immune checkpoint markers PD-1 and CTLA4, which was validated by Opal multiplex immunohistochemistry in ccRCC tissues. More CD8 + T cells and CD68 + macrophages were observed in patients expressing high GBP2. Taken together, a five-protein prognostic signature was constructed in our study. GBP2 has an oncogenic role via modulating JAK-STAT signaling and tumor immune infiltration, and thus may serve as a potential therapeutic target in ccRCC.

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