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Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology2023Dec01Vol.29issue(12)

CRISPR-CASを媒介した植物におけるゲノム編集の3BS:基本、バイオインフォマティクス、バイオセーフティ景観の探求

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Review
概要
Abstract

非標識:最近の研究における推力により、タイプIIは、アバンギャルドな植物ゲノム編集ツールとして、定期的に散在する短いパリンドロミックリピートと関連するタンパク質9(CRISPR-CAS9)システムを予測しています。RNA誘導DNAエンドヌクレアーゼ(RGEN)CAS9による部位特異的二本鎖DNA切断の誘導を促進します。ノックアウト遺伝子型(CRISPRKO)の作成に加えて、DNA配列のセクションの除去、追加、または変更は、その野生の形(WTCAS9)のCRISPR-CAS9システムによって支援されます。ヌクレアーゼドメインの不活性化は、死んだCAS9(DCAS9)を生成します。DCAS9システムは、転写活性化(CRISPRA)と転写干渉(CRISPRI)を促進するために異なるエフェクターと融合することで設計できます。したがって、CRISPR-CASは、幅広い作物のゲノム操作層として途方もない見通しを保持しています。この記事では、CRISPR-CASシステムの基礎と一般的なワークフローと、利用可能なデータベースとアルゴリズム/Web-Accessableを特別に推進するCRISPR-CAS研究を推進する際のバイオインフォマティクスの見通しの概要を説明します。編集の使用と効率の向上を支援したアプリケーション。この記事では、CRISPR-CAS編集された植物のさまざまな国の現在の規制環境に関する最新情報を提供して、ゲノム編集技術の広範な影響を強調しています。 補足情報:オンライン版には、10.1007/s12298-023-01397-3で入手可能な補足資料が含まれています。

非標識:最近の研究における推力により、タイプIIは、アバンギャルドな植物ゲノム編集ツールとして、定期的に散在する短いパリンドロミックリピートと関連するタンパク質9(CRISPR-CAS9)システムを予測しています。RNA誘導DNAエンドヌクレアーゼ(RGEN)CAS9による部位特異的二本鎖DNA切断の誘導を促進します。ノックアウト遺伝子型(CRISPRKO)の作成に加えて、DNA配列のセクションの除去、追加、または変更は、その野生の形(WTCAS9)のCRISPR-CAS9システムによって支援されます。ヌクレアーゼドメインの不活性化は、死んだCAS9(DCAS9)を生成します。DCAS9システムは、転写活性化(CRISPRA)と転写干渉(CRISPRI)を促進するために異なるエフェクターと融合することで設計できます。したがって、CRISPR-CASは、幅広い作物のゲノム操作層として途方もない見通しを保持しています。この記事では、CRISPR-CASシステムの基礎と一般的なワークフローと、利用可能なデータベースとアルゴリズム/Web-Accessableを特別に推進するCRISPR-CAS研究を推進する際のバイオインフォマティクスの見通しの概要を説明します。編集の使用と効率の向上を支援したアプリケーション。この記事では、CRISPR-CAS編集された植物のさまざまな国の現在の規制環境に関する最新情報を提供して、ゲノム編集技術の広範な影響を強調しています。 補足情報:オンライン版には、10.1007/s12298-023-01397-3で入手可能な補足資料が含まれています。

UNLABELLED: The recent thrust in research has projected the type II clustered regularly interspaced short palindromic repeats and associated protein 9 (CRISPR-Cas9) system as an avant-garde plant genome editing tool. It facilitates the induction of site-specific double-stranded DNA cleavage by the RNA-guided DNA endonuclease (RGEN), Cas9. Elimination, addition, or alteration of sections in DNA sequence besides the creation of a knockout genotype (CRISPRko) is aided by the CRISPR-Cas9 system in its wild form (wtCas9). The inactivation of the nuclease domain generates a dead Cas9 (dCas9), which is capable of targeting genomic DNA without scissoring it. The dCas9 system can be engineered by fusing it with different effectors to facilitate transcriptional activation (CRISPRa) and transcriptional interference (CRISPRi). CRISPR-Cas thus holds tremendous prospects as a genome-manipulating stratagem for a wide gamut of crops. In this article, we present a brief on the fundamentals and the general workflow of the CRISPR-Cas system followed by an overview of the prospects of bioinformatics in propelling CRISPR-Cas research with a special thrust on the available databases and algorithms/web-accessible applications that have aided in increasing the usage and efficiency of editing. The article also provides an update on the current regulatory landscape in different countries on the CRISPR-Cas edited plants to emphasize the far-reaching impact of the genomic editing technology. SUPPLEMENTARY INFORMATION: The online version contains supplementary material available at 10.1007/s12298-023-01397-3.

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