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パンデミックHIV-1であるHIV-1グループMは、チンパンジーからの先祖のレンチウイルスの単一の波及イベントから出現しました。世界中の人間から人間への広がりの間、HIV-1は複数のサブタイプに多様化しました。ここでは、私たちの学際的調査は、主に、HIV-1サブタイプC(HIV-1C)のバイラル出芽システムの進化的シナリオに光を当てています。HIV-1出芽の2つのアミノ酸モチーフ、P(T/S)APおよびYPXLモチーフのうち、HIV-1CはYPXLモチーフを失います。私たちのデータは、HIV-1Cが免疫圧を回避するためにこのモチーフを失う可能性があることを意味します。さらに、P(T/S)APモチーフは、ヒト集団におけるHIV-1拡散のレベルで依存して複製され、HIV-1Cの20%以上が重複したP(T/S)APモチーフを抱いていました。さらに、P(T/S)APモチーフの重複は、CTGトリプレットの繰り返しの拡大によって引き起こされることを示しています。全体として、我々の結果は、HIV-1が世界中の人間から人間への広がりの間にウイルスの出芽プロセスの2段階の進化を経験したことを示唆しています。
パンデミックHIV-1であるHIV-1グループMは、チンパンジーからの先祖のレンチウイルスの単一の波及イベントから出現しました。世界中の人間から人間への広がりの間、HIV-1は複数のサブタイプに多様化しました。ここでは、私たちの学際的調査は、主に、HIV-1サブタイプC(HIV-1C)のバイラル出芽システムの進化的シナリオに光を当てています。HIV-1出芽の2つのアミノ酸モチーフ、P(T/S)APおよびYPXLモチーフのうち、HIV-1CはYPXLモチーフを失います。私たちのデータは、HIV-1Cが免疫圧を回避するためにこのモチーフを失う可能性があることを意味します。さらに、P(T/S)APモチーフは、ヒト集団におけるHIV-1拡散のレベルで依存して複製され、HIV-1Cの20%以上が重複したP(T/S)APモチーフを抱いていました。さらに、P(T/S)APモチーフの重複は、CTGトリプレットの繰り返しの拡大によって引き起こされることを示しています。全体として、我々の結果は、HIV-1が世界中の人間から人間への広がりの間にウイルスの出芽プロセスの2段階の進化を経験したことを示唆しています。
The pandemic HIV-1, HIV-1 group M, emerged from a single spillover event of its ancestral lentivirus from a chimpanzee. During human-to-human spread worldwide, HIV-1 diversified into multiple subtypes. Here, our interdisciplinary investigation mainly sheds light on the evolutionary scenario of the viral budding system of HIV-1 subtype C (HIV-1C), a most successfully spread subtype. Of the two amino acid motifs for HIV-1 budding, the P(T/S)AP and YPxL motifs, HIV-1C loses the YPxL motif. Our data imply that HIV-1C might lose this motif to evade immune pressure. Additionally, the P(T/S)AP motif is duplicated dependently of the level of HIV-1 spread in the human population, and >20% of HIV-1C harbored the duplicated P(T/S)AP motif. We further show that the duplication of the P(T/S)AP motif is caused by the expansion of the CTG triplet repeat. Altogether, our results suggest that HIV-1 has experienced a two-step evolution of the viral budding process during human-to-human spread worldwide.
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