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ジャガイモの初期枯病（PEB）は、世界中の主要なジャガイモ生産地域では、拡大している期間中のジャガイモの葉の病気です。この病気または完全に耐性のあるジャガイモの品種を制御するための効果的な薬剤は存在しません。殺菌剤の大規模な使用は、病原体耐性の増加と生態学的農業の要件の可能性があるため、制限されています。この研究では、雲南省の初期枯病病原体の組成と感染特性に焦点を当て、候補の病因関連の経路と遺伝子をスクリーニングしました。Alternaria sp。の85株を分離しました。2018年から2022年まで、雲南省の3つのジャガイモ栽培地域の典型的な初期枯病スポットの菌類は、形態学的特性評価とその配列比較により、オルタナリアソラニの35系統と50株のオルタナリアオルタナタの株を特定しました。それぞれジャガイモの早期枯病を引き起こします。走査型電子顕微鏡分析により、接種後4時間後にA. solaniが葉細胞に正常に感染した後に補足を生成するSolaniのみが確認されました。ゲノムのアセンブリと注釈を介して、トランスクリプトームとプロテオーム解析を組み合わせて、次の病原性関連ユニット、転写因子、代謝経路が特定されました。（1）ペクチナーゼ、ケラチナーゼ、セルラーゼなどの細胞壁分解酵素。（2）ユビキチン化やペルオキシソームなどの分生子発芽および病原性に関連する遺伝子および経路。（3）Zn-Clus、C2H2、BZIP、BHLHなどの転写因子。これらの要素は、雲南のPEB流行の原因でした。
ジャガイモの初期枯病（PEB）は、世界中の主要なジャガイモ生産地域では、拡大している期間中のジャガイモの葉の病気です。この病気または完全に耐性のあるジャガイモの品種を制御するための効果的な薬剤は存在しません。殺菌剤の大規模な使用は、病原体耐性の増加と生態学的農業の要件の可能性があるため、制限されています。この研究では、雲南省の初期枯病病原体の組成と感染特性に焦点を当て、候補の病因関連の経路と遺伝子をスクリーニングしました。Alternaria sp。の85株を分離しました。2018年から2022年まで、雲南省の3つのジャガイモ栽培地域の典型的な初期枯病スポットの菌類は、形態学的特性評価とその配列比較により、オルタナリアソラニの35系統と50株のオルタナリアオルタナタの株を特定しました。それぞれジャガイモの早期枯病を引き起こします。走査型電子顕微鏡分析により、接種後4時間後にA. solaniが葉細胞に正常に感染した後に補足を生成するSolaniのみが確認されました。ゲノムのアセンブリと注釈を介して、トランスクリプトームとプロテオーム解析を組み合わせて、次の病原性関連ユニット、転写因子、代謝経路が特定されました。（1）ペクチナーゼ、ケラチナーゼ、セルラーゼなどの細胞壁分解酵素。（2）ユビキチン化やペルオキシソームなどの分生子発芽および病原性に関連する遺伝子および経路。（3）Zn-Clus、C2H2、BZIP、BHLHなどの転写因子。これらの要素は、雲南のPEB流行の原因でした。
Potato early blight (PEB), a foliar disease of potato during the growing period, caused by Alternaria sp., is common in major potato-producing areas worldwide. Effective agents to control this disease or completely resistant potato varieties are absent. Large-scale use of fungicides is limited due to possibility of increase in pathogen resistance and the requirements of ecological agriculture. In this study, we focused on the composition and infection characteristics of early blight pathogens in Yunnan Province and screened candidate pathogenesis-related pathways and genes. We isolated 85 strains of Alternaria sp. fungi from typical early blight spots in three potato-growing regions in Yunnan Province from 2018 to 2022, and identified 35 strains of Alternaria solani and 50 strains of Alternaria alternata by morphological characterization and ITS sequence comparison, which were identified as the main and conditional pathogens causing early blight in potato, respectively. Scanning electron microscope analysis confirmed only A. solani producing appressorium at 4 h after inoculation successfully infected the leaf cells. Via genome assembly and annotation, combine transcriptome and proteomic analysis, the following pathogenicity-related unit, transcription factors and metabolic pathway were identified: (1) cell wall-degrading enzymes, such as pectinase, keratinase, and cellulase; (2) genes and pathways related to conidia germination and pathogenicity, such as ubiquitination and peroxisomes; and (3) transcription factors, such as Zn-clus, C2H2, bZIP, and bHLH. These elements were responsible for PEB epidemic in Yunnan.
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