Pubtator 30：生物医学的知識のロックを解除するためのAI駆動の文献リソース

Pubtator 3.0（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/pubtator3/）は、最先端のAIテクニックを使用して、タンパク質、遺伝子などの重要な概念の意味的および関係検索を提供する生物医学文献リソースです。バリアント、病気、化学物質。現在、約3,600万のPubMed要約とPMC Open Access Subsetの600万件のフルテキスト記事で10億を超えるエンティティと関係の注釈を提供しています。Pubtator 3.0のオンラインインターフェイスとAPIは、これらの事前計算されたエンティティ関係と同義語を利用して、高度な検索機能を提供し、大規模な分析を可能にし、多くの複雑な情報ニーズを合理化します。一連のエンティティペアクエリを使用して、Pubtator 3.0の検索品質を紹介し、Pubtator 3.0がPubMedまたはGoogle Scholarよりも多くの記事を取得し、上位20の結果が精度が高いことを示しています。さらに、ChatGPT（GPT-4）とPubtator APIを統合すると、その応答の事実性と検証可能性が劇的に向上することを示しています。要約すると、Pubtator 3.0は、研究者が生物医学の文献を拡大し続ける豊富な富をナビゲートできるようにする包括的な機能とツールを提供し、研究を促進し、科学的発見のための貴重な洞察を解き放ちます。

PubTator 3.0 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/pubtator3/) is a biomedical literature resource using state-of-the-art AI techniques to offer semantic and relation searches for key concepts like proteins, genetic variants, diseases and chemicals. It currently provides over one billion entity and relation annotations across approximately 36 million PubMed abstracts and 6 million full-text articles from the PMC open access subset, updated weekly. PubTator 3.0's online interface and API utilize these precomputed entity relations and synonyms to provide advanced search capabilities and enable large-scale analyses, streamlining many complex information needs. We showcase the retrieval quality of PubTator 3.0 using a series of entity pair queries, demonstrating that PubTator 3.0 retrieves a greater number of articles than either PubMed or Google Scholar, with higher precision in the top 20 results. We further show that integrating ChatGPT (GPT-4) with PubTator APIs dramatically improves the factuality and verifiability of its responses. In summary, PubTator 3.0 offers a comprehensive set of features and tools that allow researchers to navigate the ever-expanding wealth of biomedical literature, expediting research and unlocking valuable insights for scientific discovery.