鉱石形成環境からのActinomycetotaバイオプロスペクティング

Actinomycetotaの天然物は、多くの臨床的に関連する治療法のインスピレーションとして機能しています。自然産物の発見の初期の勝利にもかかわらず、新しい化合物を発掘する速度は低下し、独創的なアプローチが必要です。有望な戦略の1つは、生存が困難な環境を探索することです。これらの過酷な環境は、生存を可能にするために化学的適応（天然産物など）を発達させる細菌につながると仮定されています。この調査では、鉱石形成環境、特にフッ化物鉱山に焦点を当てています。特に、極端なpH、塩分、栄養不足を備えています。ここでは、これらの過酷な環境で生物多様性と代謝を分析するために、メタゲノミクス、メタボロミクス、進化的ゲノムマイニングを利用しました。この研究は、これらの細菌の有望な生合成の可能性を明らかにし、生物活性二次代謝産物を生成する能力を実証しました。この研究は、フッ化物採掘地域内の生物療法の先駆的な努力を構成し、未知の微生物生態系と以前に未開の天然産物に関する洞察を提供します。

Natural products from Actinomycetota have served as inspiration for many clinically relevant therapeutics. Despite early triumphs in natural product discovery, the rate of unearthing new compounds has decreased, necessitating inventive approaches. One promising strategy is to explore environments where survival is challenging. These harsh environments are hypothesized to lead to bacteria developing chemical adaptations (e.g. natural products) to enable their survival. This investigation focuses on ore-forming environments, particularly fluoride mines, which typically have extreme pH, salinity and nutrient scarcity. Herein, we have utilized metagenomics, metabolomics and evolutionary genome mining to dissect the biodiversity and metabolism in these harsh environments. This work has unveiled the promising biosynthetic potential of these bacteria and has demonstrated their ability to produce bioactive secondary metabolites. This research constitutes a pioneering endeavour in bioprospection within fluoride mining regions, providing insights into uncharted microbial ecosystems and their previously unexplored natural products.