アフリカスノピラチョピの咬傷に対する皮膚マウスの反応のトランスクリプトーム分析

背景：ノミの咬傷は、宿主の一連の複雑な分子応答をトリガーする可能性があります。ただし、分子レベルでの応答の理解は、まだ比較的限られています。この研究は、脾臓からのRNAシーケンス（RNA-seq）によるノミ咬傷後のマウスの遺伝子発現の変化を定量化し、ノミ咬傷に対する宿主反応の潜在的な生物学的効果を明らかにします。 方法：RNA-seqをトランスクリプトーム分析に使用して、コントロールマウスグループとノミ咬合マウス群の間の差次的に発現した遺伝子（deg）をスクリーニングしました。遺伝子オントロジー（GO）分析と京都百科事典とゲノム（KEGG）分析は、DEGSで実行されました。免疫プロセスに関連するDEGのタンパク質間相互作用（PPI）ネットワーク分析が実行されました。最後に、スクリーニングされたDEGからいくつかの遺伝子をランダムに選択して、リアルタイムの定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（RT-QPCR）によってトランスクリプトームデータの結果を検証しました。 結果：277の上方制御および244のダウンレギュレートなど、合計521度が特定されました。上方制御されたdegによって大幅に濃縮された258のGO条件があり、419 GO項がダウンレギュレートされたDEGによって大幅に濃縮されました。上方制御されたDEGのうち、22のGO用語は免疫細胞（B細胞およびT細胞など）および免疫調節プロセスに関連していましたが、ダウンレギュレートされたDEGの中で、58 GO条件は免疫細胞および免疫調節プロセスに関連していました。PPI分析を通じて、ノミ咬傷後に大幅にダウンレギュレートされた発現レベルを持つCD40分子が宿主免疫調節に重要な役割を果たす可能性があることがわかりました。Kegg経路濃縮分析により、合計26の大幅に濃縮されたKegg経路が特定されました。RT-QPCR分析の結果は、トランスクリプトームシーケンスの結果が信頼できることを示しました。 結論：ノミの咬傷によって引き起こされるマウスのトランスクリプトームの変化の詳細な分析を通じて、ノミの咬傷がマウスの一連の生物学的および免疫学的反応を刺激する可能性があることを明らかにしました。これらの発見は、宿主に対するノミの咬傷の影響についてのより深い理解を提供するだけでなく、外部病原体と宿主との相互作用に関するさらなる研究の根拠も提供しました。これらのトランスクリプトームの変化の重要性をより深く掘り下げることは、外部病原体に対する宿主の適応反応についてさらに明らかにするのに役立つと考えています。

BACKGROUND: Flea bites could trigger a series of complex molecular responses in the host. However, our understanding of the responses at the molecular level is still relatively limited. This study quantifies the changes in gene expression in mice after flea bites by RNA sequencing (RNA-seq) from their spleens, revealing the potential biological effects of host response to flea bites. METHODS: RNA-seq was used for transcriptome analysis to screen for differentially expressed genes (DEGs) between the control mice group and the flea bite mice group. Gene ontology (GO) analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis were performed on DEGs. Protein-protein interaction (PPI) network analysis on DEGs related to immune processes was performed. Finally, we randomly selected several genes from the screened DEGs to validate the results from the transcriptome data by real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR). RESULTS: A total of 521 DEGs were identified, including 277 upregulated and 244 downregulated. There were 258 GO terms significantly enriched by upregulated DEGs and 419 GO terms significantly enriched by downregulated DEGs. Among the upregulated DEGs, 22 GO terms were associated with immune cells (e.g., B cells and T cells) and immune regulatory processes, while among the downregulated DEGs, 58 GO terms were associated with immune cells and immune regulatory processes. Through PPI analysis, we found that CD40 molecules with significantly downregulated expression levels after flea bites may play an important role in host immune regulation. Through KEGG pathway enrichment analysis, a total of 26 significantly enriched KEGG pathways were identified. The RT-qPCR analysis results indicated that the transcriptome sequencing results were reliable. CONCLUSIONS: Through in-depth analysis of transcriptome changes in mice caused by flea bites, we revealed that flea bites could stimulate a series of biological and immunological responses in mice. These findings not only provided a deeper understanding of the impact of flea bites on the host but also provided a basis for further research on the interaction between ectoparasites and the host. We believe that digging deeper into the significance of these transcriptome changes will help reveal more about the adaptive response of the host to ectoparasites.