ベトナム、ホーチミン市の感染性結膜炎の病原体プロファイル

目的：結膜炎の流行とパンデミクスは依然として世界的な負担です。この研究は、ベトナムの結膜炎に関連する病原体を包括的に特定することを目的としています。 方法：ベトナムのホーチミン市の外来診療所に提示された急性結膜炎の患者は、2022年9月から2023年3月まで登録されました。偏りのないRNAディープシーケンス（RNA-seq）を使用して、サンプル内の複製病原体を識別しました。 結果：35人の患者のサンプルを分析しました。患者の80％で病原体が特定されました。72％（95％信頼区間：54％から85％）にHADV-DまたはHADV-Bのいずれかに感染しました。検出されたRNAウイルスは、ライノウイルスとヒトコロナウイルス229eでした。細菌の病因には、肺炎連鎖球菌、ヘモフィルスインフルエンザ、およびシュードモナス属が含まれていました。1人の患者は、ライノウイルスAとHadv-Bの共感染を持っていました。真菌であるvittaforma角膜は、1人の患者で識別されました。角膜下上皮浸潤、偽膜、または耳介前リンパ節腫瘍は、どの患者でも報告されていません。 結論：ヒトアデノウイルスは、ベトナムの感染性結膜炎に関連する一般的な循環病原体です。ただし、Hadv種はベトナム内の地理的位置によって異なるようです。RNAウイルスなど、この研究で同定された他の認識されていない病原体は、より広い病原体監視が有益である可能性があることを示唆しています。

PURPOSE: Conjunctivitis epidemics and pandemics remain a global burden. This study aims to comprehensively identify pathogens associated with conjunctivitis in Vietnam. METHODS: Patients with acute conjunctivitis presented to an outpatient clinic in Ho Chi Minh City, Vietnam, were enrolled from September 2022 to March 2023. Swabs were obtained from conjunctiva and anterior nares of all patients. Unbiased RNA deep sequencing (RNA-seq) was used to identify any replicating pathogens in the samples. RESULTS: Samples from 35 patients were analyzed. A pathogen was identified in 80% of the patients. 72% (95% confidence interval: 54% to 85%) were infected with either HAdV-D or HAdV-B. RNA viruses detected were rhinoviruses and human coronavirus 229E. Bacteria etiologies included Streptococcus pneumoniae, Hemophilus influenza, and Pseudomonas spp. One patient had co-infection of rhinovirus A and HAdV-B. Vittaforma corneae, a fungus, was identified in one patient. Corneal sub-epithelial infiltrates, pseudomembranes, or pre-auricular lymphadenopathy were not reported in any patient. CONCLUSIONS: Human adenoviruses are the common circulating pathogens associated with infectious conjunctivitis in Vietnam. HAdV species, however, appear to vary between geographic locations within Vietnam. Other under-recognized pathogens identified in this study, such as RNA viruses, suggest broader pathogen surveillance may be beneficial.