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目的:ヒトデモデックスダニの細菌群集の多様性を調査し、それらのヒトデモデックスダニの役割を解明する洞察を提供するために、感染症を引き起こしました。 方法:2023年6月から7月にかけて、粘着テープ法を使用してウフ市の大学の大学生の顔から、および16SリボソームRNA(16S RRNA)遺伝子と内部転写スペーサーのV4領域(そのITS)核リボソームDNAの遺伝子は、イルミナPE250ハイスループットシーケンスプラットフォームで増幅されました。シーケンスデータは、重複する関係に従ってスプライスされ、フィルタリングされて効果的なシーケンスが得られ、運用上の分類単位(OTU)がクラスター化されました。得られたアウトの多様性インデックスが分析され、細菌群集の構造がさまざまな分類学的レベルで分析されました。 結果:合計57 483の有効なシーケンスが16S rRNA遺伝子シーケンスを使用して取得され、類似性に従って159アウトが分類されました。その後、分類学的分析には97%の類似性が含まれており、デモデックスダニの細菌は14の門、20クラス、51の注文、72の家族、および94属に属していました。プロテオバクテリアは支配的な門であり、ビブリオ、ブラジルヒゾビウム、バリオボラックスが支配的な属でした。その遺伝子シーケンスを使用して合計56の362有効なシーケンスが得られ、147 OTUが得られました。これは、5つの門、17のクラス、34の順序、68科、および93属に属し、アスコミコタ、basidiomycota、Chytridiomycotaに注釈が付けられました。支配的な門として、および代替門として、代替物、浮accuccum、ペニシリウム、サロクラジウムが支配的な属として。 結論:複数のタイプの微生物と高種の豊富さを備えた、ヒトデモデックスダニの細菌群集の組成には多様性が高くなっています。
目的:ヒトデモデックスダニの細菌群集の多様性を調査し、それらのヒトデモデックスダニの役割を解明する洞察を提供するために、感染症を引き起こしました。 方法:2023年6月から7月にかけて、粘着テープ法を使用してウフ市の大学の大学生の顔から、および16SリボソームRNA(16S RRNA)遺伝子と内部転写スペーサーのV4領域(そのITS)核リボソームDNAの遺伝子は、イルミナPE250ハイスループットシーケンスプラットフォームで増幅されました。シーケンスデータは、重複する関係に従ってスプライスされ、フィルタリングされて効果的なシーケンスが得られ、運用上の分類単位(OTU)がクラスター化されました。得られたアウトの多様性インデックスが分析され、細菌群集の構造がさまざまな分類学的レベルで分析されました。 結果:合計57 483の有効なシーケンスが16S rRNA遺伝子シーケンスを使用して取得され、類似性に従って159アウトが分類されました。その後、分類学的分析には97%の類似性が含まれており、デモデックスダニの細菌は14の門、20クラス、51の注文、72の家族、および94属に属していました。プロテオバクテリアは支配的な門であり、ビブリオ、ブラジルヒゾビウム、バリオボラックスが支配的な属でした。その遺伝子シーケンスを使用して合計56の362有効なシーケンスが得られ、147 OTUが得られました。これは、5つの門、17のクラス、34の順序、68科、および93属に属し、アスコミコタ、basidiomycota、Chytridiomycotaに注釈が付けられました。支配的な門として、および代替門として、代替物、浮accuccum、ペニシリウム、サロクラジウムが支配的な属として。 結論:複数のタイプの微生物と高種の豊富さを備えた、ヒトデモデックスダニの細菌群集の組成には多様性が高くなっています。
OBJECTIVE: To investigate the bacterial community diversity in human Demodex mites, so as to provide insights into unraveling the role of human Demodex mites in them caused infectious diseases. METHODS: From June to July 2023, Demodex mites were collected from the faces of college students in a university in Wuhu City using the adhesive tape method, and the V4 region of 16S ribosomal RNA (16S rRNA) gene and the internal transcribed spacer (ITS) gene of nuclear ribosomal DNA were amplified on an Illumina PE250 high-throughput sequencing platform. Sequencing data were spliced according to the overlapping relations and filtered to yield effective sequences, and operational taxonomic units (OTUs) was clustered. The diversity index of obtained OUTs was analyzed, and the structure of the bacterial community was analyzed at various taxonomic levels. RESULTS: A total of 57 483 valid sequences were obtained using 16S rRNA gene sequencing, and 159 OUTs were classified according to similarity. Then, OUTs at a 97% similarity were included for taxonomic analyses, and the bacteria in Demodex mites belonged to 14 phyla, 20 classes, 51 orders, 72 families, and 94 genera. Proteobacteria was the dominant phylum, and Vibrio, Bradyrhizobium and Variovorax were dominant genera. A total of 56 362 valid sequences were obtained using ITS gene sequencing, and 147 OTUs were obtained, which belonged to 5 phyla, 17 classes, 34 orders, 68 families, and 93 genera and were annotated to Ascomycota, Basidiomycota and Chytridiomycota, with Ascomycota as the dominant phylum, and Alternaria alternata, Epicoccum, Penicillium, and Sarocladium as dominant genera. CONCLUSIONS: There is a high diversity in the composition of bacterial communities in human Demodex mites, with multiple types of microorganisms and high species abundance.
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