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Nature communications2024Jun14Vol.15issue(1)

ヨーロッパのカルバペネム耐性クレブシエラ肺炎の国際的および地域の広がり

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

カルバペネム耐性の肺炎Klebsiella(CRKP)は、モバイル遺伝子要素に関連する抗生物質耐性遺伝子の拡大により、特に懸念があります。この研究では、南ヨーロッパの9か国(2016-2018)の41の病院から臨床サンプル間で回収された687のカルバペネム耐性株を収集しました。11の主要なクローン系統を特定し、ほとんどの分離株は高リスククローンST258/512、ST101、ST11、およびST307に属しています。BLAKPC様は、最も一般的なカルバペネマーゼエンコード遺伝子(46%)であり、分離株の39%にBlaoxa-48が存在していました。このEURECAコレクションと以前のEuscapeコレクション(2013-2014)との組み合わせと比較を通じて、ヨーロッパで循環するリスクの高いクローンの広がりを調査し、地域の違いを示しました。特に、ギリシャ、イタリア、スペインでBlakpcのようなST258/512、セルビアとルーマニアのBlaoxa-48 ST101、ギリシャのブランドムST11、TürkiyeでBlaoxa-48様ST14を発見しました。したがって、ヨーロッパ全体のゲノム監視は、地元のリスクマッピングの重要な洞察を提供し、制御戦略の実施に必要な適応を通知します。

カルバペネム耐性の肺炎Klebsiella(CRKP)は、モバイル遺伝子要素に関連する抗生物質耐性遺伝子の拡大により、特に懸念があります。この研究では、南ヨーロッパの9か国(2016-2018)の41の病院から臨床サンプル間で回収された687のカルバペネム耐性株を収集しました。11の主要なクローン系統を特定し、ほとんどの分離株は高リスククローンST258/512、ST101、ST11、およびST307に属しています。BLAKPC様は、最も一般的なカルバペネマーゼエンコード遺伝子(46%)であり、分離株の39%にBlaoxa-48が存在していました。このEURECAコレクションと以前のEuscapeコレクション(2013-2014)との組み合わせと比較を通じて、ヨーロッパで循環するリスクの高いクローンの広がりを調査し、地域の違いを示しました。特に、ギリシャ、イタリア、スペインでBlakpcのようなST258/512、セルビアとルーマニアのBlaoxa-48 ST101、ギリシャのブランドムST11、TürkiyeでBlaoxa-48様ST14を発見しました。したがって、ヨーロッパ全体のゲノム監視は、地元のリスクマッピングの重要な洞察を提供し、制御戦略の実施に必要な適応を通知します。

Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) are of particular concern due to the spread of antibiotic resistance genes associated with mobile genetic elements. In this study, we collected 687 carbapenem-resistant strains recovered among clinical samples from 41 hospitals in nine Southern European countries (2016-2018). We identified 11 major clonal lineages, with most isolates belonging to the high-risk clones ST258/512, ST101, ST11, and ST307. blaKPC-like was the most prevalent carbapenemase-encoding gene (46%), with blaOXA-48 present in 39% of isolates. Through the combination and comparison of this EURECA collection with the previous EuSCAPE collection (2013-2014), we investigated the spread of high-risk clones circulating in Europe exhibiting regional differences. We particularly found blaKPC-like ST258/512 in Greece, Italy, and Spain, blaOXA-48 ST101 in Serbia and Romania, blaNDM ST11 in Greece, and blaOXA-48-like ST14 in Türkiye. Genomic surveillance across Europe thus provides crucial insights for local risk mapping and informs necessary adaptions for implementation of control strategies.

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