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開発中のポリヌクレオチド配列のコンテキスト分析の新しい方法。この方法では、与えられたヌクレオチド頻度を伴う長さのn塩基のシーケンスで非ランダムリピートを見つけます。大腸菌RNAポリメラーゼのベータ、ベータ、シグマサブユニットを指定する遺伝子のコーディング領域を分析しました。短い繰り返しの高い含有量は、遺伝子によってコードされた球状タンパク質の二次構造に対応することがわかった。遺伝子のコーディング領域における非ランダム直接繰り返しの可能な進化的役割について説明します。
開発中のポリヌクレオチド配列のコンテキスト分析の新しい方法。この方法では、与えられたヌクレオチド頻度を伴う長さのn塩基のシーケンスで非ランダムリピートを見つけます。大腸菌RNAポリメラーゼのベータ、ベータ、シグマサブユニットを指定する遺伝子のコーディング領域を分析しました。短い繰り返しの高い含有量は、遺伝子によってコードされた球状タンパク質の二次構造に対応することがわかった。遺伝子のコーディング領域における非ランダム直接繰り返しの可能な進化的役割について説明します。
A new method of contextual analysis of polynucleotide sequences in developed. The method finds nonrandom repeats in the sequences of N bases in length with given nucleotide frequencies. The coding regions of genes specifying beta-, beta'-, sigma-subunits of E. coli RNA polymerase were analyzed. The high content of short repeats was found to correspond to the secondary structure of globular proteins coded by the genes. The possible evolutionary role of the nonrandom direct repeats in coding regions of genes is discussed.
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