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Communications biology2024Jun25Vol.7issue(1)

BMおよび脾臓と比較したヒトリンパ節における自然リンパ細胞のトランスクリプトームの多様性

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Comparative Study
概要
Abstract

自然リンパ球細胞(ILC)は主に組織居住者であり、ほとんどが粘膜組織内で記載されています。ただし、ヒト排出リンパ節(LNS)におけるそれらの存在と機能は不明です。私たちの研究は、ヒト腹部および胸部LNS内の47,287 CD127+ ILCの組織特異的転写プロファイルを解き放ちます。LNSには、BMまたは脾臓よりもCD127+ ILCの周波数が高いことが含まれています。BMのEILPおよびPILCを含むILC開発の独立した段階を定義します。これらの前駆細胞は、成熟ILCに区別できるナイーブILC(NILC)に加えてLNSに存在します。LNSで3つのILC1および4つのILC3サブクラスターを定義します。ILC1およびILC3サブセットには、高熱ショックタンパク質エンコード遺伝子を持つクラスターがあります。ILC1のBACH2ファミリーやILC3のATFファミリーなど、以前に認識されていないレギュロンを特定します。私たちの研究は、LNSにおけるILCの包括的な特性評価であり、人間のILCを介した免疫について詳細な理解を提供します。

自然リンパ球細胞(ILC)は主に組織居住者であり、ほとんどが粘膜組織内で記載されています。ただし、ヒト排出リンパ節(LNS)におけるそれらの存在と機能は不明です。私たちの研究は、ヒト腹部および胸部LNS内の47,287 CD127+ ILCの組織特異的転写プロファイルを解き放ちます。LNSには、BMまたは脾臓よりもCD127+ ILCの周波数が高いことが含まれています。BMのEILPおよびPILCを含むILC開発の独立した段階を定義します。これらの前駆細胞は、成熟ILCに区別できるナイーブILC(NILC)に加えてLNSに存在します。LNSで3つのILC1および4つのILC3サブクラスターを定義します。ILC1およびILC3サブセットには、高熱ショックタンパク質エンコード遺伝子を持つクラスターがあります。ILC1のBACH2ファミリーやILC3のATFファミリーなど、以前に認識されていないレギュロンを特定します。私たちの研究は、LNSにおけるILCの包括的な特性評価であり、人間のILCを介した免疫について詳細な理解を提供します。

Innate lymphoid cells (ILCs) are largely tissue-resident, mostly described within the mucosal tissues. However, their presence and functions in the human draining lymph nodes (LNs) are unknown. Our study unravels the tissue-specific transcriptional profiles of 47,287 CD127+ ILCs within the human abdominal and thoracic LNs. LNs contain a higher frequency of CD127+ ILCs than in BM or spleen. We define independent stages of ILC development, including EILP and pILC in the BM. These progenitors exist in LNs in addition to naïve ILCs (nILCs) that can differentiate into mature ILCs. We define three ILC1 and four ILC3 sub-clusters in the LNs. ILC1 and ILC3 subsets have clusters with high heat shock protein-encoding genes. We identify previously unrecognized regulons, including the BACH2 family for ILC1 and the ATF family for ILC3. Our study is the comprehensive characterization of ILCs in LNs, providing an in-depth understanding of ILC-mediated immunity in humans.

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