近接標識拡張顕微鏡（PL-EXM）は、相互標識技術を評価します

近接標識によるタンパク質間相互作用（PPI）を理解することで、細胞のメカニズムと病理学の理解が革新されました。HRP、頂点、バイオイド、ターボイド、μmapなどのさまざまな近接標識技術は、プロテオミクスプロファイリングのためにPPIまたはオルガネラをビオチン化するために広く使用されています。ただし、これらの技術の精度と効率のラベル付けの変動は、しばしばプロテオーム検出の再現性が限られています。拡張顕微鏡と近接標識技術を組み合わせたスーパー解像度イメージング技術である、近接標識膨張顕微鏡（PL-EXM）を導入することにより、この永続的な課題に対処します。PL-EXMは、広く利用可能な顕微鏡で最大17 nmの解像度を有効にし、異なる近接標識法の標識精度、効率、および誤検知の視覚的な比較を提供しました。私たちの質量分析プロテオームの結果は、PL-EXMイメージングが近接標識技術の選択を導き、プロテオームの結果を新しい空間情報で解釈するのに信頼できることを確認しました。

Understanding protein-protein interactions (PPIs) through proximity labeling has revolutionized our comprehension of cellular mechanisms and pathology. Various proximity labeling techniques, such as HRP, APEX, BioID, TurboID, and μMap, have been widely used to biotinylate PPIs or organelles for proteomic profiling. However, the variability in labeling precision and efficiency of these techniques often results in limited reproducibility in proteomic detection. We address this persistent challenge by introducing proximity labeling expansion microscopy (PL-ExM), a super-resolution imaging technique that combines expansion microscopy with proximity labeling techniques. PL-ExM enabled up to 17 nm resolution with microscopes widely available, providing visual comparison of the labeling precision, efficiency, and false positives of different proximity labeling methods. Our mass spectrometry proteomic results confirmed that PL-ExM imaging is reliable in guiding the selection of proximity labeling techniques and interpreting the proteomic results with new spatial information.