トランスポゾンTN3のDNA配列分析：TN3の転置に関与する3つの遺伝子と3つの部位

トランスポゾンTN3およびその転位に影響する20の変異の完全なヌクレオチド配列が報告されています。合成制限部位のランダムな挿入によってin vitroで生成された突然変異は、新しい制限部位に隣接する小さな重複または削除が含まれていることが証明されました。これらの変異の表現型とDNA配列を決定することにより、重複する表現型およびヌクレオチドMAPを生成することができました。この4957 bpトランスポゾンは、総コーディング容量の350 bpを除くすべてを占める3つのポリペプチドをエンコードします。これらのタンパク質は、TNPA遺伝子によってコードされる高分子量ポリペプチド（1015アミノ酸）であるトランスポサゼです。TN3特異的リプレッサー、TNPR遺伝子によってコードされる低分子量ポリペプチド（185アミノ酸）。および286アミノ酸ベータラクタマーゼ。TN3に隣接する38 bpの反転リピートは、TN3が転移するためにCISで絶対に必要であるように見えます。遺伝データは、TN3にはIRS（内部解像度サイト）と指定された3番目の部位（Gill et al。、1978）が含まれていることを示唆しており、その結果、TN3の2つの完全なコピーがレシピエントDNAに直接繰り返されるように挿入されます。TN3の完全なコピーのこれらの直接的な繰り返しは、転位における中間体であり、IRSサイトはTN3の単一コピーを残すために直接反復のその後の分離に必要であることを示唆しています（Gill et al。、1978）。トランスポサゼのアミノ末端内の23ヌクレオチド配列は、逆繰り返し反復と強い配列相同性を共有することが内部解像度部位である可能性があります。

The complete nucleotide sequence of the transposon Tn3 and of 20 mutations which affect its transposition are reported. The mutations, generated in vitro by random insertion of synthetic restriction sites, proved to contain small duplications or deletions immediately adjacent to the new restriction site. By determining the phenotype and DNA sequence of these mutations we were able to generate an overlapping phenotypic and nucleotide map. This 4957 bp transposon encodes three polypeptides which account for all but 350 bp of its total coding capacity. These proteins are the transposase, a high molecular weight polypeptide (1015 amino acids) encoded by the tnpA gene; the Tn3-specific repressor, a low molecular weight polypeptide (185 amino acids) encoded by the tnpR gene; and the 286 amino acid beta-lactamase. The 38 bp inverted repeats flanking Tn3 appear to be absolutely required in cis for Tn3 to transpose. Genetic data suggest that Tn3 contains a third site (Gill et al., 1978), designated IRS (internal resolution site), whose absence results in the insertion of two complete copies of Tn3 as direct repeats into the recipient DNA. We suggest that these direct repeats of complete copies of Tn3 are intermediates in transposition, and that the IRS site is required for recombination and subsequent segregation of the direct repeats to leave a single copy of Tn3 (Gill et al., 1978). A 23 nucleotide sequence within the amino terminus of the transposase which shares strong sequence homology with the inverted repeat may be the internal resolution site.