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背景：JN.1 SARS-COV-2バリアントの出現後、L455F、F456L、R346Tなどのスパイクタンパク質に重要な変異を持つバリアントが同定されました。2024年1月上旬、KP.2（JN.1.11.1.2）バリアントが臨床サンプルで最初に特定されました。その世界的な有病率の増加は、その感染と臨床的影響に対する懸念を引き起こしました。この研究では、KP.2*の（*はKP.2とそのすべてのサブライネージを示しています）マハラシュトラ州の臨床的重症度を調査しています。 方法：この研究は、2023年11月1日から2024年6月24日までの収集日を伴う5,173インドのSARS-COV-2全ゲノムシーケンスを含みました。次のクレードソフトウェア（バージョン3.8.0）を使用して、シーケンスの系統分析を実行しました。人口統計の詳細を確認し、KP.2*のケースに関する臨床情報を取得するために、電話インタビューが実施されました。取得したデータを記録し、Microsoft®Excel（Microsoft Corporation、レドモンド、ワシントン州）を使用して分析しました。 結果：分析された5,173のシーケンスのうち、JN.1*は主要な系統（65.96％、3412/5173）として登場し、その後KP.2*（7.83％、405/5173）およびKP.1*（3.27％、169が続きました。/5173）。インドでは、KP.2*が2023年12月2日にオリッサで最初に検出されました。KP.2*シーケンスの大部分はマハラシュトラ（248/405、61.23％）からのもので、その後に西ベンガル（38/405、9.38％）、グジャラート（27/405、6.67％）、ラジャスタン（24/405、5.93％）。マハラシュトラは、2024年1月24日に最初のKP.2*シーケンスを報告しました。臨床研究には、マハラシュトラ州のKP.2*バリアントの160症例が含まれていました。これらのうち、95.63％（153/160）には、発熱（108/160、67.50％）、寒さ（87/160、54.38％）、咳（80/160、50％）、痛み（咳（80/160、50％）などの軽度の症状があります。44/160、27.5％）、体の痛み（43/160、26.88％）、および疲労（42/160、26.25％）。症例の約33.13％（53/160）には、施設内検疫または入院が必要であり、残りは自宅で管理されていました。入院した人々のうち、50.94％（27/53）が保守的な治療を受け、49.06％（26/53）は補足酸素、ステロイド、または抗ウイルス療法を必要としていました。ワクチン接種状況に関しては、症例の89.38％（143/160）が少なくとも1回のコビッド19ワクチンを受けましたが、10％（16/160）はワクチン接種を受けていませんでしたが、非ワクチン接種の大部分は子供がゼロの子供です9年（7/16、43.75％）。KP.2*症例の全体的な回復率は99.38％（159/160）で、病気に屈する0.62％（1/160）のみでした。 結論：KP.2バリアントは、インドとマハラシュトラ州で支配的なSARS-COV-2バリアントになりました。罹患した個人が軽度の症状を経験しているにもかかわらず、研究により、不安定な突然変異による中和力価が低く、感染性が高いことが示されており、KP.2の世界的支配への潜在的な上昇が示唆されています。
背景：JN.1 SARS-COV-2バリアントの出現後、L455F、F456L、R346Tなどのスパイクタンパク質に重要な変異を持つバリアントが同定されました。2024年1月上旬、KP.2（JN.1.11.1.2）バリアントが臨床サンプルで最初に特定されました。その世界的な有病率の増加は、その感染と臨床的影響に対する懸念を引き起こしました。この研究では、KP.2*の（*はKP.2とそのすべてのサブライネージを示しています）マハラシュトラ州の臨床的重症度を調査しています。 方法：この研究は、2023年11月1日から2024年6月24日までの収集日を伴う5,173インドのSARS-COV-2全ゲノムシーケンスを含みました。次のクレードソフトウェア（バージョン3.8.0）を使用して、シーケンスの系統分析を実行しました。人口統計の詳細を確認し、KP.2*のケースに関する臨床情報を取得するために、電話インタビューが実施されました。取得したデータを記録し、Microsoft®Excel（Microsoft Corporation、レドモンド、ワシントン州）を使用して分析しました。 結果：分析された5,173のシーケンスのうち、JN.1*は主要な系統（65.96％、3412/5173）として登場し、その後KP.2*（7.83％、405/5173）およびKP.1*（3.27％、169が続きました。/5173）。インドでは、KP.2*が2023年12月2日にオリッサで最初に検出されました。KP.2*シーケンスの大部分はマハラシュトラ（248/405、61.23％）からのもので、その後に西ベンガル（38/405、9.38％）、グジャラート（27/405、6.67％）、ラジャスタン（24/405、5.93％）。マハラシュトラは、2024年1月24日に最初のKP.2*シーケンスを報告しました。臨床研究には、マハラシュトラ州のKP.2*バリアントの160症例が含まれていました。これらのうち、95.63％（153/160）には、発熱（108/160、67.50％）、寒さ（87/160、54.38％）、咳（80/160、50％）、痛み（咳（80/160、50％）などの軽度の症状があります。44/160、27.5％）、体の痛み（43/160、26.88％）、および疲労（42/160、26.25％）。症例の約33.13％（53/160）には、施設内検疫または入院が必要であり、残りは自宅で管理されていました。入院した人々のうち、50.94％（27/53）が保守的な治療を受け、49.06％（26/53）は補足酸素、ステロイド、または抗ウイルス療法を必要としていました。ワクチン接種状況に関しては、症例の89.38％（143/160）が少なくとも1回のコビッド19ワクチンを受けましたが、10％（16/160）はワクチン接種を受けていませんでしたが、非ワクチン接種の大部分は子供がゼロの子供です9年（7/16、43.75％）。KP.2*症例の全体的な回復率は99.38％（159/160）で、病気に屈する0.62％（1/160）のみでした。 結論：KP.2バリアントは、インドとマハラシュトラ州で支配的なSARS-COV-2バリアントになりました。罹患した個人が軽度の症状を経験しているにもかかわらず、研究により、不安定な突然変異による中和力価が低く、感染性が高いことが示されており、KP.2の世界的支配への潜在的な上昇が示唆されています。
BACKGROUND: Following the emergence of the JN.1 SARS-CoV-2 variant, variants with key mutations in the spike protein, such as L455F, F456L, and R346T, were identified. In early January 2024, the KP.2 (JN.1.11.1.2) variant was first identified in clinical samples. Its increasing global prevalence has raised concerns over its transmission and clinical impact. The study investigates KP.2*'s (*indicates KP.2 and all its sub-lineages) spread and clinical severity in Maharashtra. METHODS: This study involved 5,173 Indian SARS-CoV-2 whole genome sequences with collection dates between November 1, 2023 and June 24, 2024. Lineage analysis of sequences was performed using Nextclade software (version 3.8.0). Telephonic interviews were conducted to confirm the demographic details and obtain clinical information on the KP.2* cases. The obtained data were recorded and analyzed using Microsoft® Excel (Microsoft Corporation, Redmond, WA). RESULTS: Among the 5,173 sequences analyzed, JN.1* appeared as the predominant lineage (65.96%, 3412/5173), followed by KP.2* (7.83%, 405/5173) and KP.1* (3.27%, 169/5173). In India, KP.2* was first detected on December 2, 2023, in Odisha. The majority of KP.2* sequences were from Maharashtra (248/405, 61.23%), followed by West Bengal (38/405, 9.38%), Gujarat (27/405, 6.67%), and Rajasthan (24/405, 5.93%). Maharashtra reported its first KP.2* sequences on January 24, 2024. The clinical study included 160 cases of the KP.2* variant from Maharashtra. Of these, 95.63% (153/160) presented with mild symptoms, such as fever (108/160, 67.50%), cold (87/160, 54.38%), cough (80/160, 50%), sore throat (44/160, 27.5%), body ache (43/160, 26.88%), and fatigue (42/160, 26.25%). About 33.13% (53/160) of the cases required institutional quarantine or hospitalization, with the rest managed at home. Among those hospitalized, 50.94% (27/53) received conservative treatment, while 49.06% (26/53) needed supplemental oxygen, steroids, or antiviral therapy. Regarding the vaccination status, 89.38% (143/160) of the cases had received at least one dose of the COVID-19 vaccine, whereas 10% (16/160) were unvaccinated, with the majority of the unvaccinated being children aged zero to nine years (7/16, 43.75%). The overall recovery rate for KP.2* cases was 99.38% (159/160), with only 0.62% (1/160) succumbing to the disease. CONCLUSION: The KP.2 variant has become the dominant SARS-CoV-2 variant in India and Maharashtra. Despite the affected individuals experiencing mild symptoms, studies have shown lower neutralization titers and high infectivity due to FLiRT mutations, suggesting KP.2's potential rise to global dominance.
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