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International journal of systematic and evolutionary microbiology2024Oct01Vol.74issue(10)

Polymorphospora lycopeni sp nov、バイヤンディアンの湖side土壌サンプルから分離されたリコピン産生のアクチノ菌

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

リコピンを産生する新しいアクチノマイセテは、HBU208002Tと呼ばれ、中国のXiong'an New AreaにあるBaiyangdianに収集された湖side土壌サンプルから分離され、その分類学的地位はポリフェイシックアプローチによって調査されました。16S RRNA遺伝子配列の比較に基づく系統解析により、株HBU208002T株はPolymorphospora属内に収まり、Polymorphospora Rubra JCM 14904T(99.73%ID)と密接に関連していることが明らかになりました。ただし、平均ヌクレオチド同一性(ANI)、デジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション(DDDH)および平均アミノ酸同一性(AAI)値は、HBU208002T株とP. rubra JCM 14904Tの間でそれぞれ91.78、44.7および91.6%であり、低くなりました。原核生物微生物定義種のANI(95-96%)、DDH(> 70%)およびAAI(> 95%)のしきい値よりも。株HBU208002Tの主な脂肪酸はISO-C16:0、C17:1Ω8Cでした。株HBU208002TのメナキノンはMK-8(H8)およびMK9(H4)であり、P。rubraJCM 14904TのメナキノンはMK-10(H6)、MK-10(H4)、MK-9(H6)、MKでした。-9(H4)。一方、いくつかの表現型特性と抗菌活性は、P。rubraJCM 14904TからHBU208002T株を区別しました。HBU208002T株は、Fusarium graminearum、Fusarium v​​erticillioides、およびBotrytis cinereaに阻害効果を示しましたが、P。rubraJCM 14904Tには活性がありませんでした。したがって、株HBU208002Tは、Polymorphospora lycopeniという名前が提案されたPolymorphospora属の新規種を表すものとして割り当てる必要があります。型ひずみはhbu208002t(= kctc49833t = gdmcc4.236t)です。

リコピンを産生する新しいアクチノマイセテは、HBU208002Tと呼ばれ、中国のXiong'an New AreaにあるBaiyangdianに収集された湖side土壌サンプルから分離され、その分類学的地位はポリフェイシックアプローチによって調査されました。16S RRNA遺伝子配列の比較に基づく系統解析により、株HBU208002T株はPolymorphospora属内に収まり、Polymorphospora Rubra JCM 14904T(99.73%ID)と密接に関連していることが明らかになりました。ただし、平均ヌクレオチド同一性(ANI)、デジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション(DDDH)および平均アミノ酸同一性(AAI)値は、HBU208002T株とP. rubra JCM 14904Tの間でそれぞれ91.78、44.7および91.6%であり、低くなりました。原核生物微生物定義種のANI(95-96%)、DDH(> 70%)およびAAI(> 95%)のしきい値よりも。株HBU208002Tの主な脂肪酸はISO-C16:0、C17:1Ω8Cでした。株HBU208002TのメナキノンはMK-8(H8)およびMK9(H4)であり、P。rubraJCM 14904TのメナキノンはMK-10(H6)、MK-10(H4)、MK-9(H6)、MKでした。-9(H4)。一方、いくつかの表現型特性と抗菌活性は、P。rubraJCM 14904TからHBU208002T株を区別しました。HBU208002T株は、Fusarium graminearum、Fusarium v​​erticillioides、およびBotrytis cinereaに阻害効果を示しましたが、P。rubraJCM 14904Tには活性がありませんでした。したがって、株HBU208002Tは、Polymorphospora lycopeniという名前が提案されたPolymorphospora属の新規種を表すものとして割り当てる必要があります。型ひずみはhbu208002t(= kctc49833t = gdmcc4.236t)です。

A novel actinomycetes producing lycopene, designated HBU208002T, was isolated from a lakeside soil sample collected in Baiyangdian, located in Xiong'an New Area of China, and its taxonomic position was investigated by a polyphasic approach. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequence comparisons revealed that the strain HBU208002T fell within the genus Polymorphospora and was closely related to Polymorphospora rubra JCM 14904T (99.73% identity). However, the average nucleotide identity (ANI), digital DNA-DNA hybridization (dDDH) and average amino acid identity (AAI) values between the strain HBU208002T and P. rubra JCM 14904T were 91.78, 44.7 and 91.6%, respectively, which were lower than the ANI (95-96%), DDH (>70%) and AAI (>95%) thresholds of prokaryotic microbial defined species. The predominant fatty acids of the strain HBU208002T were iso-C16:0, C17:1 ω8c. The menaquinones of the strain HBU208002T were MK-8(H8) and MK9(H4), while those of P. rubra JCM 14904T were MK-10(H6), MK-10(H4), MK-9(H6) and MK-9(H4). Meanwhile, some phenotypic characterizations and antibacterial activities distinguished the strain HBU208002T from P. rubra JCM 14904T. The strain HBU208002T exhibited inhibitory effects on Fusarium graminearum, Fusarium verticillioides and Botrytis cinerea, but P. rubra JCM 14904T had no activity. Therefore, the strain HBU208002T should be assigned as representing a novel species of the genus Polymorphospora, for which the name Polymorphospora lycopeni was proposed. The type strain is HBU208002T (=KCTC49833T = GDMCC4.236T).

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