中国における犬の円錐形の新しいジェノタイピングの定義と分子特性

犬の円中性（CCV）はグローバルに検出されていますが、その遺伝子型は不均一に特徴付けられたままです。CCVの進化とジェノタイピングを理解するために、2018年から2023年にかけて887犬の直腸スワブが収集されました。完全なゲノム配列に基づいたP距離/周波数ヒストグラムと系統樹によれば、新たに得られた21の中国語および84の参照CCV株は、主に7つのサブタイプに分割されました（CCV-1A、CCV-1B、CCV-1C、CCV-1D、CCV-1E、CCV-2A、およびCCV-2B）。新しく取得された21のCCVのうち、9株がCCV-1Dに属し、2つの株がCCV-1Bに属し、残りの株はCCV-1Cに属していました。組換え分析により、異なるサブタイプ、宿主、および国のCCV株間で組換えイベントが発生したことが示されました。CCV Capsidタンパク質は、2つのサイト（T58Q、P239A）が地域の特異性と3（Q57T、E150Q、およびT195Q）を示す2つのサイト（T58Q、P239A）を備えた19種類のサイトを特徴としています。したがって、このジェノタイピング分析は、グローバルに見られるCCV株の分子特性の参照を提供します。

Canine circovirus (CCV) has been detected globally, but its genotyping remains unevenly characterized. To comprehend the evolution and genotyping of CCV, 887 rectal swabs of dogs were collected during 2018-2023. According to p-distance/frequency histograms and phylogenetic trees based on complete genome sequences, the 21 newly obtained Chinese and 84 reference CCV strains were mainly divided into 7 subtypes (CCV-1a, CCV-1b, CCV-1c, CCV-1d, CCV-1e, CCV-2a, and CCV-2b). Among the 21 newly obtained CCVs, 9 strains belonged to CCV-1d, 2 strains belonged to CCV-1b, and the remaining strains belonged to CCV-1c. Recombination analysis indicated that recombination events occurred between CCV strains of different subtypes, hosts, and countries. The CCV capsid protein features 19 variable sites, with 2 sites (T58Q, P239A) displaying regional specificity and 3 (Q57T, E150Q, and T195Q) manifesting subtype specificity. Therefore, this genotyping analysis provides a reference for the molecular characteristics of CCV strains found globally.