敗血症性ショックと脳卒中におけるCOX6CとNDUFB3の役割

背景：敗血症性ショックは、急性循環障害を特徴とする臨床症候群です。脳卒中は、脳組織の損傷によって引き起こされる急性脳血管疾患です。ただし、COX6CとNDUFB3とそれらとの関係は不明です。 方法：ストロークデータセットGSE58294および浄化槽ショックデータセットGSE15491は、遺伝子発現Omnibusデータベースからダウンロードされました。差次的に発現した遺伝子（DEG）、加重遺伝子共発現ネットワーク分析、タンパク質間相互作用ネットワークの構造と分析、機能的濃縮分析、遺伝子セット濃縮分析、免疫浸潤分析、および比較毒性ゲオゲロニックデータベース（CTD）分析のスクリーニングを実施しました。。遺伝子発現ヒートマップが描画されました。ターゲットスキャンは、中央のdegを調節するmiRNAをスクリーニングしました。 結果：合計664度が得られました。遺伝子オントロジー分析は、それらが主に白血球の活性化、細胞内小胞、好中球の活性化、およびサイトカイン受容体活性に濃縮されていることを示しました。遺伝子とゲノム分析の京都百科事典によれば、それらは主に代謝経路、ファゴソーム、および黄色ブドウ球菌感染に濃縮されています。コア遺伝子（UQCRQ、USMG5 [ATP5MD]、COX6C、NDUFB3、ATP5L [ATP5MG]、COX7C、NDUFA1、NDUFA4）は、敗血症性ショックおよび脳卒中サンプルで高度に発現しました。CTD分析では、8つのコア遺伝子が肝臓の肥大、炎症、増殖、線維症、および壊死に関連していることがわかりました。 結論：COX6CおよびNDUFB3遺伝子は、敗血症性ショックと脳卒中で高度に発現しています。COX6CおよびNDUFB3遺伝子が高いほど、予後が悪化します。

BACKGROUND: Septic shock is a clinical syndrome characterized by acute circulatory disturbance. Stroke is an acute cerebrovascular disease caused by brain tissue damage. However, the relationship of COX6C and NDUFB3 to them is unclear. METHOD: The stroke dataset GSE58294 and the septic shock dataset GSE15491 were downloaded from the gene expression omnibus database. Screening of differentially expressed genes (DEGs), weighted gene co-expression network analysis, construction and analysis of protein-protein interaction network, functional enrichment analysis, gene set enrichment analysis, immune infiltration analysis, and comparative toxicogenomics database (CTD) analysis were performed. Gene expression heat map was drawn. TargetScan screened miRNAs regulating central DEGs. RESULTS: A total of 664 DEGs were obtained. Gene ontology analysis showed that they were mainly enriched in leukocyte activation, intracellular vesicle, neutrophil activation, and cytokine receptor activity. According to Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analysis, they are mainly enriched in metabolic pathways, phagosomes, and Staphylococcus aureus infection. Core genes (UQCRQ, USMG5 [ATP5MD], COX6C, NDUFB3, ATP5L [ATP5MG], COX7C, NDUFA1, NDUFA4) were highly expressed in septic shock and stroke samples. CTD analysis found that eight core genes are associated with liver enlargement, inflammation, proliferation, fibrosis, and necrosis. CONCLUSION: COX6C and NDUFB3 genes are highly expressed in septic shock and stroke. The higher the COX6C and NDUFB3 genes, the worse the prognosis.