綿のMYC遺伝子ファミリーのゲノム全体の同定と分析：正常な成長とストレス反応中の進化と発現プロファイル

背景：ジャスモン酸（JA）シグナル伝達経路の転写因子として機能する骨髄腫症（MYC）の遺伝子ファミリーは、多様な動物や植物種全体でかなりのレベルの保全を示します。綿は、繊維生産のために最も広く使用されている植物です。それにもかかわらず、MYCSのメンバーと綿の生物ストレスにどのように反応するかについて報告する文献の不足があります。 方法：Interpro、Cottongenなどに基づいて綿のMyc遺伝子ファミリーを採掘するためにバイオインフォマティクス分析を使用しました。さらに、GT1-MOTIFがGHMYCSで最も豊富であると予想されており、GT1-Motifが光応答性GHMYCで重要な役割を果たすことを示しています。V. dahliaeやアブラムシのゴシピイを含む生物ストレス下でのGhmycsの発現パターンが評価され、陰性調節因子として機能するクラス1および-3 GhmycsのGhmycsがVerticillium Wiltおよびaphidsに対する耐性に関与していることを示唆しています。クラス-3 GHMYCS遺伝子は、主に女性組織で発現していることがわかりました。興味深いことに、綿のGhmycs内の相互作用発現バイアスが明らかにされていることも決定され、結果がDTサブゲノムのクラス1Aおよびクラス2 GHMYCの遺伝子発現が遺伝子機能に直接影響を与える可能性があることを示しました。 結論：この研究は、GHMYC遺伝子の分子特性と生物学的機能のさらなる研究の基礎を築くための基礎を築くための基礎を築くための個々のホメログを操作することにより、研究者とブリーダーが綿特性を強化するための研究の方向性を提供します。

BACKGROUND: The gene family of myelomatosis (MYC), serving as a transcription factor in the jasmonate (JA) signaling pathway, displays a significant level of conservation across diverse animal and plant species. Cotton is the most widely used plant for fiber production. Nevertheless, there is a paucity of literature reporting on the members of MYCs and how they respond to biotic stresses in cotton. METHODS: Bioinformatics analysis was used to mine the MYC gene family in cotton based on InterPro, cottongen, etc. Results: The gene structure, conserved motifs, and upstream open reading frames of 32 GhMYCs in Gossypium hirsutum were identified. Moreover, it was anticipated that the GT1-motif is the most abundant in GhMYCs, indicating that the GT1-motif plays a significant role in light-responsive GhMYCs. The expression patterns of GhMYCs under biotic stresses including V. dahliae and Aphid gossypii were evaluated, suggesting that GhMYCs in class-1 and -3 GhMYCs, which function as negative regulators, are involved in resistance to verticillium wilt and aphids. The class-3 GhMYCs genes were found to be mostly expressed in female tissues. Interestingly, it was also determined that the homeologous expression bias within GhMYCs in cotton was uncovered, and results showed that the gene expression of class-1A and class-2 GhMYCs in the Dt sub-genome may have a direct impact on gene function. CONCLUSIONS: This study provides a research direction for researchers and breeders to enhance cotton traits through manipulating individual or multiple homeologs, which laid a foundation for further study of the molecular characteristics and biological functions of GhMYC gene.