哺乳類の前mRNAスプライシングにおける3 'スプライス部位コンセンサスシーケンスの役割

前mRNAスプライシングは、2段階の経路によって発生することが示されています。最初の段階では、前mRNAが5 'スプライス部位で切断され、最初のエクソンRNA種とイントロンと2番目のエクソン（IVS1-エキソン2 RNA種）で構成されるRNA種を生成します。第2段階では、3 'スプライス部位での切断とエクソンのライゲーションが発生し、その結果、無傷のイントロンが切除されます。切除されたイントロンおよびIVS1-エキソン2 RNA種は、イントロンの5 '端がイントロンの3'端近くのアデノシン残基に2'-5 'ホスホディエステル結合によって結合されるラリアットの形です。ここでは、3 'スプライス部位での切断はスプライシング反応の第2段階まで発生しないが、3'スプライス部位のコンセンサスシーケンスの一部が5 'スプライス部位の切断とラリアット形成に必要であることを示します。したがって、高等真核生物では、少なくとも3つの配列要素がスプライシング反応の開始に関与します：5 'スプライス部位、3'スプライス部位コンセンサスシーケンス、およびRNA分岐点。

Pre-mRNA splicing has been shown to occur by a two-step pathway. In the first stage, the pre-mRNA is cleaved at the 5' splice site, generating the first exon RNA species and an RNA species composed of the intron and second exon (IVS1-exon 2 RNA species). In the second stage, cleavage at the 3' splice site and ligation of the exons occurs, resulting in the excision of the intact intron. The excised intron and IVS1-exon 2 RNA species are in the form of a lariat in which the 5' end of the intron is joined to an adenosine residue near the 3' end of the intron by a 2'-5' phosphodiester bond. Here we show that although cleavage at the 3' splice site does not occur until the second stage of the splicing reaction, at least a portion of the 3' splice site consensus sequence is necessary for 5' splice site cleavage and lariat formation. Thus, in higher eukaryotes at least three sequence elements participate in the initiation of the splicing reaction: the 5' splice site, 3' splice site consensus sequence and the RNA branchpoint.