オリゴヌクレオチドの固相合成中のヌクレオシドホスホルアミダイト試薬によるグアニン塩基の修飾

ヌクレオシド 3'-ホスホルアミダイトおよびクロロホスファイト試薬は、グアニンのラクタム官能基と反応することがわかっています。この反応は、多数のグアニン塩基を含むオリゴデオキシリボヌクレオチドを自動固相合成装置で調製した場合に不満足な結果を引き起こしました。グアニン修飾は不安定であり、脱プリンと鎖の切断を引き起こします。この副反応は、O6 位を保護することで排除できます。新しい O6-p-ニトロフェニルエチルデオキシグアノシン ホスホラミダイト誘導体 8 を使用して、最大 24 個のグアニン塩基を含む配列を調製し、結果が大幅に向上しました。ヘキサトリアコンタヌクレオチド d(CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCA) も、O6 保護デオキシグアノシン ヌクレオシドを使用して調製されました。

Nucleoside 3'-phosphoramidite and chlorophosphite reagents have been found to react with the lactam function of guanine. This reaction caused unsatisfactory results when oligodeoxyribonucleotides containing a large number of guanine bases were prepared in an automated solid phase synthesizer. The guanine modification is unstable, and leads to depurination and chain cleavage. This side reaction can be eliminated by protecting the O6-position. A new O6-p-nitrophenylethyldeoxyguanosine phosphoramidite derivative, 8, was used to prepare sequences containing up to 24 guanine bases with greatly improved results. A hexatriacontanucleotide, d(CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCA), was also prepared using O6-protected deoxyguanosine nucleosides.