陽子核磁気共鳴調査と環式水溶液中の二重肝デオキシリボヌクレオチドにおけるグアニンN-1およびチミンN-3水素結合プロトンの電流計算

メソッドは、水溶液中の既知の配列の二本鎖オリゴデオキシリボヌクレオチドのプロトン核磁気共鳴スペクトルの特定の塩基対にグアニン-N（1）およびチミン-N（3）Hプロトンを割り当てるための概要を示しています。リング電流計算は、DNA B型二重ヘリカル構造における最寄りの傍塩基ペアのピリミジンおよびプリンリングからのグアニンN（1）Hおよびチミン-N（3）Hプロトンのアップフィールドシフトを評価するために使用されています。13.6 +/- 0.1 ppmおよび14.6 +/- 0.2 ppmの化学シフトは、それぞれ孤立したG.C塩基対のグアニン-N（1）Hプロトンに割り当てられます。

Methods are outlined for assigning the guanine-N(1)H and thymine-N(3)H protons to particular base pairs in the proton nuclear magnetic resonance spectra of double-stranded oligodeoxyribonucleotides of known sequence in aqueous solution. Ring current calculations have been used to evaluate the upfield shifts of the guanine-N(1)H and thymine-N(3)H protons from the pyrimidine and purine rings of nearest-neighbor base pairs in DNA B-type double-helical structures. Chemical shifts of 13.6 +/- 0.1 ppm and 14.6 +/- 0.2 ppm are assigned to the guanine-N(1)H proton of an isolated G.C base pair and the thymine-N(3)H proton of an isolated A.T base pair, respectively.