COLE1プラスミド複製の制御：RNA Iのプライマー転写産物への結合プロセス

COLE1プライマープロモーターからの転写産物（RNA II）は、複製起点の近くにテンプレートDNAを備えた持続的なハイブリッドを形成します。ハイブリダイズされたRNA IIは、RNAASE Hによって切断され、プライマーを形成します。RNA IのRNA IIへの結合は、ハイブリダイゼーションを阻害し、プライマーの形成を防ぎます。この結合は、製品の識別によって実証されます。RNAASE T1を使用した製品の分析により、ペアリングがRNA Iの5 '端またはその近くで開始し、3'端に向かって伝播することが明らかになりました。RNAの5 '末端から5つのヌクレオチドを除去すると、その結合活性が大幅に減少します。ペアリングを開始する前に、RNA Iは一本鎖ループでRNA IIと相互作用します。この相互作用は一時的なものですが、5'END領域から開始するRNA Iの全長に沿った完全なペアリングを促進します。

A transcript (RNA II) from the ColE1 primer promoter forms a persistent hybrid with the template DNA near the replication origin. The hybridized RNA II is cleaved by RNAase H to form the primer. Binding of RNA I to RNA II inhibits the hybridization and thus prevents primer formation. The binding is demonstrated by identification of the product. Analyses of the product with RNAase T1 revealed that pairing initiates at or near the 5' end of RNA I and propagates toward its 3' end. Removal of five nucleotides from the 5' end of RNA I greatly reduces its binding activity. Prior to initiation of pairing, RNA I interacts with RNA II at their single-stranded loops. This interaction is transient but facilitates complete pairing along the entire length of RNA I that initiates from the 5'-end region.