シトクロムCオキシダーゼサブユニットI、URF2、およびショウジョウバエミトコンドリアDNAにおける3つのTRNAの遺伝子

URF2、TRNATRP、TRNACYS、TRNATYR、CYTOCHROME CオキシダーゼサブユニットI（COI）の遺伝子は、ショウジョウバエYakuba mtDNA分子の配列セグメント内で同定されています。5つの遺伝子は、与えられた順序で配置されています。TRNACYSおよびTRNATYR遺伝子の転写は複製と同じ方向にありますが、URF2、TRNATRP、およびCOI遺伝子の転写は反対方向にあります。これらの遺伝子の同様の配置は、哺乳類のmtDNAに見られますが、後者ではtRNAALAおよびtRNAASN遺伝子がTRNATRP遺伝子とTRNACYS遺伝子の間に位置していることを除きます。また、第2鎖DNA合成の開始に関連する哺乳類mtDNAのTRNAASN遺伝子とTRNACYS遺伝子の間に見られる配列は、D。yakubamtDNA分子のこの領域では見られません。D. Yakuba Coi遺伝子には標準的な翻訳開始コドンがないため、Quadruplet ATAAがこの機能に役立つ可能性を考慮します。他のD. Yakubaミトコンドリアポリペプチド遺伝子と同様に、URF2およびCOI遺伝子のAGAコドンは、マウスおよび酵母MTDNAの同等の遺伝子のアルギニン指定コドンに対応していませんが、セリンを調整するコドンに最も頻繁に対応します。

Genes for URF2, tRNAtrp, tRNAcys, tRNAtyr and cytochrome c oxidase subunit I (COI) have been identified within a sequenced segment of the Drosophila yakuba mtDNA molecule. The five genes are arranged in the order given. Transcription of the tRNAcys and tRNAtyr genes is in the same direction as replication, while transcription of the URF2, tRNAtrp and COI genes is in the opposite direction. A similar arrangement of these genes is found in mammalian mtDNA except that in the latter, the tRNAala and tRNAasn genes are located between the tRNAtrp and tRNAcys genes. Also, a sequence found between the tRNAasn and tRNAcys genes in mammalian mtDNA, which is associated with the initiation of second strand DNA synthesis, is not found in this region of the D. yakuba mtDNA molecule. As the D. yakuba COI gene lacks a standard translation initiation codon, we consider the possibility that the quadruplet ATAA may serve this function. As in other D. yakuba mitochondrial polypeptide genes, AGA codons in the URF2 and COI genes do not correspond in position to arginine-specifying codons in the equivalent genes of mouse and yeast mtDNAs, but do most frequently correspond to serine-specifying codons.