核酸成分の光誘発性radical反応配列と塩基の効果 - リボヌクレオチドのプリンとピリミジンの反応性に対する塩基相互作用

プリンとピリミジンの2-プロパノールとの反応は、イニシエーターとして300 nMを超えるラムダとジテルトブチル過酸化物の光と光化学的に誘導され、さまざまなアデノシン、グアノシン、およびウリジン含有リボナクレオチドに適用されました。ヌクレオチドのヘテロサイクリック塩基の反応性を支配するルールを決定するため。プリン部分の反応性は、適切なヌクレオチド（抗またはsyn）の立体構造と、リン酸基のリボース部分への結合部位に依存することがわかった。3'-ヒドロキシルでブロックされたアデノシン部分（抗コンフォメーションを仮定）は、5'-ヒドロキシルでブロックされたものよりも速く反応しました。グアノシン部分の反応性（シンの立体構造を想定する傾向）は、リン酸塩の結合部位とは無関係でした。さまざまなヌクレオチドのウリジン部分は、広範囲の反応性を示しました。ウリジンの反応性と、次の2番目のプリンとの相互作用の積み重ねに関与することとの相関関係を作ることができました。したがって、u-u-u、g-u、u-g、a-u-a、およびa-u-gのウリジン部分は反応性でしたが、a-uおよびa-u-uの部分は反応しませんでした。したがって、ヌクレオチドのウリジン部分の相対反応性は、ピリミジン純粋な積み重ねの程度の尺度として使用でき、その逆も同様です。

The reaction with 2-propanol of purines and pyrimidines, induced photochemically with light of lambda greater than 300 nm and di-tert-butyl peroxide as an initiator, was applied to a variety of adenosine-, guanosine-, and uridine-containing ribonucleotides in order to determine the rules which govern the reactivity of the heterocyclic bases of nucleotides. The reactivity of the purine moieties was found to depend on the conformation of the appropriate nucleotide (anti or syn) and on the site of binding of the phosphate group to the ribose moiety. Adenosine moieties (assuming an anti conformation) blocked at their 3'-hydroxyl reacted faster than those blocked at their 5'-hydroxyl. The reactivity of the guanosine moieties (tending to assume a syn conformation) was independent of the site of binding of the phosphate. The uridine moieties of the various nucleotides exhibited a wide range of reactivity. A correlation between the reactivity of the uridines and their involvement in stacking interactions with next- and second-neighboring purines could be made. Thus, the uridine moieties of U-U-U, G-U, U-G, A-U-A, and A-U-G were reactive, while those of A-U and A-U-U were unreactive. The relative reactivity of uridine moieties of nucleotides can, therefore, be used as a measure of the extent of pyrimidine-purine stacking and vice versa.