食道扁平上皮癌細胞株におけるCDKN2BおよびCDKN2遺伝子のゲノムDNAおよびメッセンジャーRNA発現変化の変化

タンパク質p15とp16をコードする遺伝子CDKN2B（MTS2）およびCDKN2（MTS1）はどちらも染色体帯域9P21に位置しています。これは、食道癌を含む多くの一次ヒト腫瘍で頻繁にホモ接合性およびヘテロ接合の欠失が発生する軌跡です。CDKN2およびCDKN2Bは、細胞周期のG1相中のサイクリン依存性キナーゼ4阻害剤（INK41）および対照細胞増殖のファミリーに属します。それらの不活性化は、人間の癌の制御されていない成長に寄与する可能性があります。CdKN2BとCdKN2が食道腫瘍形成に関与しているかどうかを調査するために、9つの食道扁平癌細胞株におけるCDKN2およびCDKN2Bのホモ接合性欠失、遺伝子内変異、メッセンジャーRNA（mRNA）発現を研究しました。ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）増幅により、9つの細胞株のうち5つ（55％）が、染色体帯域9P21のCDKN2B、CDKN2、および/または隣接する遺伝子座のホモ接合性欠失を明らかにしたことが明らかになりました。逆転写酵素-PCR（RT-PCR）を使用して、9細胞株のCDKN2およびCDKN2B mRNAを調べました。CDKN2およびCDKN2B mRNAの欠如は、これらの遺伝子を含むホモ接合の欠失と完全に相関していました。ホモ接合の欠失を欠いている細胞株におけるコーディング配列全体のDNA配列決定により、CDKN2BまたはCDKN2の微妙な遺伝子内変異は検出されませんでした。2つの細胞株は、CDKN2を除くホモ接合の欠失を示しました。これらの2つの削除の1つは、CDKN2Bも除外しました。これらの結果は、CdKN2BおよびCdKN2の不活性化が食道細胞の悪性表現型に寄与し、ホモ接合の欠失がCDKN2BおよびCDKN2の不活性化の主要なメカニズムである可能性があることを示唆しています。あるいは、CdKN2B/CDKN2に隣接する遺伝子または遺伝子は、この遺伝子座での欠失のターゲットを構成する場合があります。

The genes CDKN2B (MTS2) and CDKN2 (MTS1) encoding the proteins p15 and p16 are both located on chromosomal band 9p21, a locus at which frequent homozygous and heterozygous deletions occur in many primary human tumors, including esophageal carcinoma. CDKN2 and CDKN2B belong to a family of cyclin-dependent kinase 4 inhibitors (INK41) and control cell proliferation during the G1 phase of the cell cycle. Their inactivation may contribute to uncontrolled growth in human cancers. To investigate whether CDKN2B and CDKN2 are involved in esophageal tumorigenesis, we studied homozygous deletion, intragenic mutation, and messenger RNA (mRNA) expression of CDKN2 and CDKN2B in nine esophageal squamous cancer cell lines. Polymerase chain reaction (PCR) amplification revealed that five of the nine cell lines (55%) manifested homozygous deletions of CDKN2B, CDKN2, and/or flanking loci on chromosomal band 9p21. Reverse transcriptase-PCR (RT-PCR) was used to examine CDKN2 and CDKN2B mRNA in the nine cell lines. Lack of CDKN2 and CDKN2B mRNA correlated perfectly with homozygous deletion involving these genes. No subtle intragenic mutations of CDKN2B or CDKN2 were detected by DNA sequencing of their entire coding sequences in any cell lines lacking homozygous deletion. Two of the cell lines manifested homozygous deletions excluding CDKN2; one of these two deletions also excluded CDKN2B. These results suggest that inactivation of CDKN2B and CDKN2 may contribute to the malignant phenotype in esophageal cells and that homozygous deletion may be the predominant mechanism for inactivation of CDKN2B and CDKN2. Alternatively, a gene or genes adjacent to CDKN2B/CDKN2 may constitute the target(s) of deletion at this locus.