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Human molecular genetics1995Jun01Vol.4issue(6)

YACクローニングMUS MusculusテロメアDNA:染色体の遠位テロメアの物理的、遺伝的、in situおよびSTSマーカー10

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

3つのMus Musculus DBA/2 YACライブラリは、半YACテロメアクローニングベクターを使用して構築されました。この機能的補完アプローチは、マウスゲノムの末端制限断片を含むライブラリを生成します。3つのライブラリすべてをスクリーニングすると、マウス端子リピートシーケンス(TTAGGG)nを含む線形YACを運ぶ32の独立クローンが分離されました。これらのYACは、染色体末端に近いマウスゲノムの領域を分離するリソースを提供し、既存の従来のYACライブラリーから除外されます。それらのユーティリティを実証するために、最初の(TTAGGG)N含有YAC分離されたMTEL-1からハイブリダイゼーションプローブを分離しました。このプローブは、BAL31エキソヌクレアーゼによる前処理に敏感なマウスゲノムの約70 kb kpnlフラグメントを検出します。このプローブのシーケンスから生成されたPCRベースの遺伝マーカーは、Eucib間バッククロスの染色体10の最も遠位のアンカー軌跡から4.4 cmから4.4 cmです。この遺伝子座のSTSプライマー、D10HGU1を使用して、市販のマウスYACライブラリからYAC 110F4を分離しました。蛍光in situハイブリダイゼーションは、YAC 110F4が染色体10の遠位テロメアにハイブリダイジングすることを示しています。D10HGU1などの遺伝的マーカーにより、マウスの遺伝子マップの端を定義することで、MAPを閉じます。

3つのMus Musculus DBA/2 YACライブラリは、半YACテロメアクローニングベクターを使用して構築されました。この機能的補完アプローチは、マウスゲノムの末端制限断片を含むライブラリを生成します。3つのライブラリすべてをスクリーニングすると、マウス端子リピートシーケンス(TTAGGG)nを含む線形YACを運ぶ32の独立クローンが分離されました。これらのYACは、染色体末端に近いマウスゲノムの領域を分離するリソースを提供し、既存の従来のYACライブラリーから除外されます。それらのユーティリティを実証するために、最初の(TTAGGG)N含有YAC分離されたMTEL-1からハイブリダイゼーションプローブを分離しました。このプローブは、BAL31エキソヌクレアーゼによる前処理に敏感なマウスゲノムの約70 kb kpnlフラグメントを検出します。このプローブのシーケンスから生成されたPCRベースの遺伝マーカーは、Eucib間バッククロスの染色体10の最も遠位のアンカー軌跡から4.4 cmから4.4 cmです。この遺伝子座のSTSプライマー、D10HGU1を使用して、市販のマウスYACライブラリからYAC 110F4を分離しました。蛍光in situハイブリダイゼーションは、YAC 110F4が染色体10の遠位テロメアにハイブリダイジングすることを示しています。D10HGU1などの遺伝的マーカーにより、マウスの遺伝子マップの端を定義することで、MAPを閉じます。

Three Mus musculus DBA/2 YAC libraries were constructed using a half-YAC telomere cloning vector. This functional complementation approach yields libraries which include terminal restriction fragments of the mouse genome. Screening all three libraries led to the isolation of 32 independent clones which carry linear YACs containing the mouse terminal repeat sequence, (TTAGGG)n. These YACs provide a resource to isolate regions of the mouse genome close to chromosome termini and excluded from existing conventional YAC libraries. To demonstrate their utility, a hybridization probe was isolated from Mtel-1, the first (TTAGGG)n-containing YAC isolated. This probe detects a approximately 70 kb Kpnl fragment in the mouse genome which is sensitive to pretreatment with BAL31 exonuclease. A PCR-based genetic marker generated from the sequence of this probe maps 4.4 cM from the most distal anchor locus on chromosome 10 in the EUCIB interspecific backcross. STS primers for this locus, D10Hgu1, were used to isolate YAC 110F4 from a commercially available mouse YAC library. Fluorescence in situ hybridization demonstrates that YAC 110F4 hybridizes to the distal telomere of chromosome 10. Clones in this collection of telomere YACs therefore partially overlap clones in conventional YAC libraries, and thus the previously unavailable terminal regions of the mouse genome can now be linked with the developing mouse STS YAC contig. Genetic markers such as D10Hgu1 allow the ends of the mouse genetic map to be defined, thus closing the map.

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