推定M（ORF 6）およびN（ORF 7）遺伝子のブタ生殖および呼吸器症候群ウイルス（PRRSV）の系統解析：米国とヨーロッパにおけるPRRSVの2つの遺伝子型の存在への影響

異なるウイルスを伴うブタ生殖および呼吸器症候群ウイルス（PRRSV）の5つの米国分離株の推定膜（M）タンパク質（ORF 6）およびヌクレオカプシド（N）タンパク質（ORF 7）遺伝子をクローン化して配列決定しました。PRRSVの遺伝的変異と系統関係を決定するために、これらの分離株から推定されるMおよびNタンパク質の推定アミノ酸配列は、他のPRRSV分離株、および提案された動脈系グループの他のメンバーと既知の範囲で整列しました。乳酸脱水素エレビ酸塩ウイルス（LDV）および馬動脈炎ウイルス（EAV）。毒性が異なる米国およびカナダのPRRSV分離株の推定MおよびN遺伝子には、96-100％のアミノ酸配列同一性がありました。ただし、それらのアミノ酸配列は、ヨーロッパのPRRSV分離株のアミノ酸配列から大きく異なり、それぞれ57-59％と78-81％の同一性のみを示しました。提案された動脈群の推定MおよびN遺伝子に基づいて構築された系統樹は類似しており、米国とヨーロッパのPRRSV分離株の両方がLDVに関連しており、EAVに遠く関連していることが示されました。米国とヨーロッパのPRRSV分離株は2つの異なるグループに分類され、米国とヨーロッパのPRRSV分離株が2つの異なる遺伝子型を表していることを示唆しています。

The putative membrane (M) protein (ORF 6) and nucleocapsid (N) protein (ORF 7) genes of five U.S. isolates of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) with differing virulence were cloned and sequenced. To determine the genetic variation and the phylogenetic relationship of PRRSV, the deduced amino acid sequences of the putative M and N proteins from these isolates were aligned, to the extent known, with other PRRSV isolates, and also other members of the proposed arterivirus group including lactate dehydrogenase-elevating virus (LDV) and equine arteritis virus (EAV). There was 96-100% amino acid sequence identity in the putative M and N genes among U.S. and Canadian PRRSV isolates with differing virulence. However, their amino acid sequences varied extensively from those of European PRRSV isolates, and displayed only 57-59% and 78-81% identity, respectively. The phylogenetic trees constructed on the basis of the putative M and N genes of the proposed arterivirus group were similar and indicated that both U.S. and European PRRSV isolates were related to LDV and were distantly related to EAV. The U.S. and European PRRSV isolates fell into two distinct groups, suggesting that U.S. and European PRRSV isolates represent two distinct genotypes.