マウスHOXA-10遺伝子の発現パターンとそのホメオドメインの配列認識は、腹部B様遺伝子の特定の特性を明らかにしています

腹部B（ABDB）ファミリーのホメオボックス遺伝子は、脊椎動物HOX遺伝子の明確なサブセットを構成します。このファミリーのメンバーであるマウスHOXA-10遺伝子の分析により、このクラスに固有のいくつかの特性が明らかになりました。HOXA-10、A10-1およびA10-2の2つの転写産物は、それぞれ55 kDa（399アミノ酸）と16 kDa（96アミノ酸）のホメオドメインタンパク質をエンコードします。これらのタンパク質は、共通の3 'エクソンによってコードされる同一のホメオドメインとC末端領域を持っていますが、代替5'エクソンの使用により、N末端領域のサイズでは大きく異なります。A10-2型の5 'エクソンは、次の3'遺伝子であるHoxa-9の転写産物にも存在し、クラスター内の隣接するABDB HOX遺伝子間でスプライシングが発生する可能性があることを示しています。両方のHOXA-10転写産物は、後体および近位肢芽に同一の発現パターンを示し、それらをABDBの形態形成および調節転写産物と区別し、これらの構造のパターン化における他のABDB HOX遺伝子との役割を示唆しました。最後に、結合部位の選択により、TTATコアシーケンスを備えたHoxa-10 Homeodomainコンセンサス結合部位としてシーケンスAA（A/T）TTTTATTACが特定されました。したがって、TTATコアの優先認識は、ABDBクラスをAntennapedia（ANTP）クラス遺伝子製品と区別し、TAATコアに結合します。したがって、脊椎動物では、構造的類似性、転写調節、発現部位、および結合部位の好みがすべてABDBとANTP HOX遺伝子を区別するのに役立ちます。

Homeobox genes of the Abdominal B (AbdB) family constitute a distinct subset of vertebrate Hox genes. Analysis of the murine Hoxa-10 gene, one member of this family, revealed several properties specific to this class. Two transcripts of Hoxa-10, a10-1 and a10-2, encode homeodomain proteins of 55 kDa (399 amino acids) and 16 kDa (96 amino acids), respectively. These proteins have identical homeodomains and C-terminal regions encoded by a common 3' exon but differ significantly in the sizes of their N-terminal regions because of the usage of alternative 5' exons. The 5' exon of the a10-2 form is also present in transcripts of Hoxa-9, the next 3' gene, indicating that splicing can occur between adjacent AbdB Hox genes within a cluster. Both Hoxa-10 transcripts demonstrated identical patterns of expression in the posterior body and proximal limb bud, differentiating them from AbdB morphogenetic and regulatory transcripts and suggesting a role with other AbdB Hox genes in the patterning of these structures. Finally, a binding site selection identified the sequence AA(A/T)TTTTATTAC as the Hoxa-10 homeodomain consensus binding site, with a TTAT core sequence. Preferential recognition of a TTAT core therefore differentiates the AbdB class from Antennapedia (Antp) class gene products which bind a TAAT core. Thus, in vertebrates, structural similarities, coordinate transcriptional regulation, sites of expression, and binding site preferences all serve to distinguish AbdB from Antp Hox genes.