Saccharomyces cerevisiaeのDEAHファミリーRNAヘリカーゼ遺伝子に非常に類似した、大腸菌のTERC領域におけるHRPA遺伝子のクローニングと特性評価

E.coli K-12のTERC領域の系統的ヌクレオチド配列分析の過程で、順序付けられたラムダファージクローンを使用することにより、PRP2と高度な配列類似性を示したHRPAと呼ばれる遺伝子の存在を発見しました。Saccharomyces cerevisiaeのPRP16およびPRP22遺伝子。これらの酵母遺伝子の産物は、mRNAスプライシングで役割を果たすことが知られており、DEAHファミリーと呼ばれるタンパク質のグループに属します。HRPA遺伝子は、原核生物のDEAHファミリー遺伝子の最初の例です。それをコードするタンパク質のN末端領域には、RNAヘリカーゼに特徴的な保存された配列伸びが含まれています。その分子量は146 kDaと計算されます。以前は、135 kDaタンパク質がMoir et alによって特定されました。[J.バクテリオール。（1992）174、2102-2110]この地域では、HRPAによってエンコードされたものと同じです。HRPA遺伝子産物のC末端領域には、E.coliのリボソームタンパク質S1のRNA結合モチーフが含まれているようです。HRPA遺伝子の破壊は、E.coliの成長に不可欠ではないことを示唆しました。

During the course of systematic nucleotide sequence analysis of the terC region of E.coli K-12 by using the ordered lambda phage clones, we found the presence of a gene, termed hrpA, that showed a high degree of sequence similarity to the PRP2, PRP16 and PRP22 genes of Saccharomyces cerevisiae. The products of these yeast genes are known to play their roles in mRNA splicing, and belong to a group of proteins collectively called the DEAH family. The hrpA gene is the first example of a DEAH family gene in prokaryotes. The N-terminal region of the protein it encodes contains conserved sequence stretches characteristic of an RNA helicase. Its molecular mass is calculated to be 146 kDa. Previously, a 135 kDa protein was identified by Moir et al. [J. Bacteriol. (1992) 174, 2102-2110] in this region which is most likely identical to that encoded by hrpA. The C-terminal region of the hrpA gene product seems to contain an RNA binding motif weakly resembling that of ribosomal protein S1 of E.coli. Disruption of the hrpA gene suggested that it is not essential for the growth of E.coli.