ショウジョウバエの構造het-aトランスポゾン：テロメアを形成するレトロトランスポゾンのような要素

ショウジョウバエのテロメアは、他の生物のテロメアとは大きく異なるようです。転位可能な要素であるHET-Aは、テロメアを形成する上で大きな役割を果たし、テロメラーゼで生成された繰り返しが見つからないため、唯一の構造要素である可能性があります。HET-Aは染色体の端にのみ変換されます。レトロトランスポゾンのように見えますが、テロメア機能に関連する可能性のある新しい構造的特徴があります。クローン化されたHet-A要素からのコンセンサスシーケンスは、約6 kbの要素を定義します。コーディング領域には、哺乳類のHIV-1レトロウイルスのフレームシフト領域に似たシーケンスに-1フレームシフトがあるレトロトランスポゾンのようなオーバーラップオープンリーディングフレーム（ORF）があります。両方のHET-A ORFには、RNA結合を示唆するモチーフが含まれています。HET-A固有の特徴には、長い非コーディング領域、3 'のORFSが含まれ、要素の約半分を占めています。この領域には、不完全なシーケンスの繰り返しが定期的に配列されており、オリゴ（a）で終了し、元素の端をマークし、ポリデニル化RNA転位中間体を示唆しています。この3 'リピート領域は、ヘテロクロマチンで構造的な役割を持っている可能性があります。ORFSの領域5 'である染色体上の各完全なHET-Aの最も遠い部分には、染色体の末端構造を生成する可能性のある異常な保存された特徴があります。

Telomeres of Drosophila appear to be very different from those of other organisms. A transposable element, HeT-A, plays a major role in forming telomeres and may be the sole structural element, since telomerase-generated repeats are not found. HeT-A transposes only to chromosome ends. It appears to be a retrotransposon but has novel structural features, which may be related to its telomere functions. A consensus sequence from cloned HeT-A elements defines an element of approximately 6 kb. The coding region has retrotransposon-like overlapping open reading frames (ORFs) with a -1 frameshift in a sequence resembling the frameshift region of the mammalian HIV-1 retrovirus. Both the HeT-A ORFs contain motifs suggesting RNA binding. HeT-A-specific features include a long non-coding region, 3' of the ORFs, which makes up about half of the element. This region has a regular array of imperfect sequence repeats and ends with oligo(A), marking the end of the element and suggesting a polyadenylated RNA transposition intermediate. This 3' repeat region may have a structural role in heterochromatin. The most distal part of each complete HeT-A on the chromosome, the region 5' of the ORFs, has unusual conserved features, which might produce a terminal structure for the chromosome.