甲状腺ホルモン受容体モノマー、ホモダイマー、およびヘテロダイマー（レチノイド-X受容体を含む）は、甲状腺ホルモン反応要素の異なるヌクレオチド配列と接触します

甲状腺ホルモン受容体（TRS）は、モノマー、ホモダイマー、およびレチノイド-X受容体（RXR）などの核タンパク質を甲状腺ホルモン応答要素（TRES）に結合します。ただし、どのヌクレオチドが特定のTREでどのヌクレオチドが接触するかは不明です。合成DR4（4ヌクレオチドスペーサーを備えた直接繰り返しとして配置されたTREハーフサイト）およびチックリソ酵素TRE、F2（6ヌクレオチドスペーサーを備えた逆パリンドロームとして配置されたハーフサイト）の正確な接触部位を特定するために）、さまざまなTR複合体について、移動性シフトアッセイ、およびジメチルスルファートおよびKMNO4 DNA修飾干渉アッセイが採用されました。第一に、これらのTREの下流の半ばに結合したTRアルファモノマー。一方、TR Alphaホモディマーは両方の半サイトに結合しました。TR Alpha/RXR Alpha Heterodimerも両方のハーフサイトにバインドされていますが、ダウンストリームのハーフサイトに接触するために「好まれている」。第二に、DR4の特定の側面と間隔シーケンスは、接触部位とTRアルファモノマーとホモダイマーの結合に影響を与えましたが、TR Alpha/RXR Alpha heterodimerには影響しませんでした。最後に、基底プロモーターに関する両方の方向にDR4またはF2を含むレポータープラスミドを使用した共輸送研究は、TR/RXRヘテロダイマーによるダウンストリームハーフサイトとの優先的な接触が最大転写活性化に重要である可能性があるという証拠を提供します。

Thyroid hormone receptors (TRs) bind as monomers, homodimers, and heterodimers with nuclear proteins such as retinoid-X receptors (RXRs) to thyroid hormone response elements (TREs). However, it is not known which nucleotides each TR complex contacts in a particular TRE. To identify the precise contact sites on a synthetic DR4 (TRE half-sites arranged as a direct repeat with a four-nucleotide spacer) and a chick lysoenzyme TRE, F2 (half-sites arranged as an inverted palindrome with a six-nucleotide spacer), for various TR complexes, mobility shift assays, and dimethylsulfate and KMnO4 DNA modification interference assays were employed. First, TR alpha monomer bound to the downstream half-site of these TREs, whereas TR alpha homodimer bound to both half-sites. TR alpha/RXR alpha heterodimer also bound to both half-sites, but "preferred" to contact the down-stream half-site. Second, the specific flanking and spacing sequences of DR4 influenced the contact sites and the binding of TR alpha monomer and homodimer, but not TR alpha/RXR alpha heterodimer. Finally, cotransfection studies, using reporter plasmids containing DR4 or F2 in both orientations with respect to the basal promoter, provide evidence that preferential contact with the down-stream half-site by TR/RXR heterodimer may be important for maximal transcriptional activation.