Rho依存性転写終了の減少により、大腸菌のNUSAに依存しない成長が可能になります

nusaとrhoは、転写の伸長と終了に影響を与える不可欠な大腸菌タンパク質です。唯一のnusA遺伝子には大きな削除/置換が含まれているため、nusaを発現できない大腸菌誘導体は、バクテリアが転写終了を減らすRho変異も運ぶことを条件として実行可能であることを示しています。このRhoを介した抑制は、アミノ酸変化を変化させるアミノ酸変化134 [Rho（E134D）]またはアミノ酸変化352（Rho1）の変化を変化させるため、nusa誘発性大腸菌の成長を可能にするため、対立遺伝子特異的ではありません。ただし、両方のRho変異は、同様に転写終了を8〜9倍減少させます。NUSAの重要な役割は、特定の部位でRNAポリメラーゼの一時停止を強化し、転写と翻訳の緊密な結合を可能にすることであると提案します。この結合は、新生RNAへのRhoアクセスおよび/または動きを妨げ、転写の早期終了をブロックします。したがって、nusa依存性結合は、低いRho活性を持つ変異体ではそれほど重要ではないはずです。大腸菌がnusaなしで成長するという事実は、nusaはRNAポリメラーゼのサブユニットではなくアクセサリー因子と見なされるべきであると主張しています。

NusA and Rho are essential Escherichia coli proteins that influence transcription elongation and termination. We show that an E. coli derivative unable to express NusA, because its sole nusA gene contains a large deletion/substitution, is viable providing that the bacterium also carries a rho mutation that reduces transcription termination. This Rho-mediated suppression is not allele specific, since either a mutation changing amino acid 134 [rho(E134D)] or a mutation changing amino acid 352 (rho1) allows growth of a nusA-deleted E. coli. However, both rho mutations similarly decrease transcription termination 8- to 9-fold. We propose that the essential role of NusA is to enhance pausing of RNA polymerase at certain sites, permitting tight coupling of transcription and translation. This coupling interferes with Rho access to and/or movement on the nascent RNA and blocks premature termination of transcription. Thus, NusA-dependent coupling should be less important in a mutant with low Rho activity. The fact that E. coli grows without NusA argues that NusA should be considered an accessory factor rather than a subunit of RNA polymerase.