アクリジンテザープラチナジアミン錯体とシスプラチンによるプラチナDNA架橋を検出するための双方向転写フットプリントの使用

双方向転写フットプリントを使用して、シスプラチンによるDNAのプラチン化を調べ、（a）エチルまたはプロピル基による非反応性アミノ基のサイクル化によるこれらの相互作用の調節を調べ、（b）さらなる添加のさらなる添加フェニルエチルグループまたはフェニルペンチル基のいずれかによってリンクされたペンダントインターカレーター（9-アミノアクリジン）。テンプレート鎖上のすべての5'-ggおよび5'-agシーケンスですべての誘導体について、トラストランド架橋が検出されましたが、同じ部位では、テンプレート非テンプレート鎖上の場合、転写閉塞をもたらしませんでした。アミノ基のサイクリスの効果はほとんどありませんでしたが、インターカレーターをさらに添加すると、3つの応答が生じました。1つおよび3つのヌクレオチドによるブロックされた転写産物の時間依存性の増加です。プラチナ酸塩のシーケンス選択性の低下。シスプラチンのアミノ部分につながれたペンダントインターカレーターを使用したこれらの誘導体の見かけの鎖間架橋の減少。

Bidirectional transcription footprinting has been used to probe the platination of DNA by cisplatin, and to examine the modulation of these interactions by (a) cyclisation of the non-reactive amino group by either ethyl or propyl groups, and (b) the further addition of a pendant intercalator (9-amino acridine) linked by either phenylethyl or phenylpentyl groups. Intrastrand crosslinking was detected for all derivatives at all 5'-GG and 5'-AG sequences on the template strand, but the same sites did not result in transcriptional blockages when on the non-template strand. There was little effect of cyclysation of the amino groups, but the further addition of an intercalator resulted in three responses: a time-dependent increase of the blocked transcript by one and three nucleotides; a reduction of the sequence selectivity of platination; a decrease of apparent interstrand crosslinking for these derivatives with a pendant intercalator tethered to the amino moiety of cisplatin.