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Immunogenetics19960101Vol.44issue(5)

MHCクラスI領域内のマウスTCTEX-5遺伝子のヒトホモログのクローニング

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文献タイプ:
  • Comparative Study
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

位置クローン戦略を使用してヘモクロマトーシス遺伝子(HFE)を特定し、HLA-AおよびHLA-F遺伝子座の近くにある400キロ塩基(KB)の領域からcDNA選択により7つのcDNAを分離しました。この論文では、HCG V(ヘモクロマトーシス候補遺伝子)と呼ばれる対応する遺伝子の1つの研究を、150 kbのcentmericをHLA-Aに局在させたことを報告します。この遺伝子は、1.8 kb転写産物の形で遍在的に発現し、進化中に明らかによく保存されていることがわかった。遺伝子は3.1 kbに及び、3つのエクソンと2つのイントロンで編成されています。1620塩基対(BP)のcDNAは、378 bpのオープンリーディングフレームを示し、126アミノ酸ポリペプチドをコードし、マウスTCTEX-5遺伝子の予測生成物(T複合体、精巣が発現)の予測産物と強い同一性を示しました。染色体17のT複合体。HCGV遺伝子は、HFEと多型マーカーの間の結合不均衡領域におけるその局在化に関して、ヘモクロマトーシスの潜在的な候補として評価されました。ヘモクロマトーシス患者における欠失と点変異の研究は、コード領域内の単一のBP多型を明らかにしました。しかし、関連する疾患の変化は見つかりませんでした。したがって、HCG Vがヘモクロマトーシスの病因に関与する可能性は低いと結論付けています。

位置クローン戦略を使用してヘモクロマトーシス遺伝子(HFE)を特定し、HLA-AおよびHLA-F遺伝子座の近くにある400キロ塩基(KB)の領域からcDNA選択により7つのcDNAを分離しました。この論文では、HCG V(ヘモクロマトーシス候補遺伝子)と呼ばれる対応する遺伝子の1つの研究を、150 kbのcentmericをHLA-Aに局在させたことを報告します。この遺伝子は、1.8 kb転写産物の形で遍在的に発現し、進化中に明らかによく保存されていることがわかった。遺伝子は3.1 kbに及び、3つのエクソンと2つのイントロンで編成されています。1620塩基対(BP)のcDNAは、378 bpのオープンリーディングフレームを示し、126アミノ酸ポリペプチドをコードし、マウスTCTEX-5遺伝子の予測生成物(T複合体、精巣が発現)の予測産物と強い同一性を示しました。染色体17のT複合体。HCGV遺伝子は、HFEと多型マーカーの間の結合不均衡領域におけるその局在化に関して、ヘモクロマトーシスの潜在的な候補として評価されました。ヘモクロマトーシス患者における欠失と点変異の研究は、コード領域内の単一のBP多型を明らかにしました。しかし、関連する疾患の変化は見つかりませんでした。したがって、HCG Vがヘモクロマトーシスの病因に関与する可能性は低いと結論付けています。

Using a positional cloning strategy to identify the hemochromatosis gene (HFE), we isolated seven cDNAs by cDNA selection from a region of 400 kilobases (kb) located near the HLA-A and HLA-F loci. In this paper, we report the study of one of the corresponding genes, referred to as HCG V (hemochromatosis candidate gene), localized 150 kb centromeric to HLA-A. This gene was found to be expressed ubiquitously in the form of a 1.8 kb transcript, and to be apparently well conserved during evolution. The gene spanned 3.1 kb and is organized in three exons and two introns. The cDNA of 1620 base pairs (bp) showed an open reading frame of 378 bp, encoding for a 126 amino acid polypeptide which displayed a strong identity with the predicted product of a mouse Tctex-5 gene (t complex, testis expressed) localized in the t complex on chromosome 17. The HCG V gene was assessed as a potential candidate for hemochromatosis in regard to its localization in the linkage disequilibrium area between HFE and polymorphic markers. The study of deletions and point mutations in hemochromatosis patients revealed a single bp polymorphism within the coding region; however, no associated disease changes were found. Therefore we conclude that HCG V is unlikely to be involved in the pathogenesis of hemochromatosis.

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