5S RDNAスペーサーシーケンスデータに基づくユーカリとアンゴフォラの系統発生

5S RDNA繰り返しのシーケンスは、4つのアウトグループ分類群（Arillastrum Group）、2つのアンゴフォラ種、および19のユーカリ種（すべての非公式亜属の代表を含む）から決定されています。アラインメントは、他の植物と同様に、タンデムに繰り返される5S rRNA遺伝子が高度に保存されている一方で、非コード化された遺伝子間スペーサーは可変であることを示しています。特定の分類群で重複と修正を受けた50ベースペア（BP）の繰り返し要素は、スペーサー内で識別可能であり、多くのばらつきを説明します。主要なクレードを定義するスペーサーには、他にもいくつかのMultiriseDue削除/挿入イベントがありました。インデルのイベントと50 bp要素の修正に基づいて、ユーカリのブラッドウッド（非公式のサブジェネラ・ブレケラとコリムビア）種のスペーサーは、ユーカリの非血液材種よりもアンゴフォラのものに類似していることが明らかです。節約分析では、ユーカリが真空系であることが示され、血液材はユーカリの他の地域よりもアンゴフォラとより密接に関連していました。この発見は、ユーカリの分類学的改訂をサポートしています。

Sequences of the 5S rDNA repeat have been determined from four outgroup taxa (Arillastrum group), 2 Angophora species, and 19 Eucalyptus species (including representatives from all informal subgenera). Alignment shows that, as in other plants, the tandemly repeated 5S rRNA genes are highly conserved while the noncoding intergenic spacers are variable. A 50-base pair (bp) repeating element, which has undergone duplication and modification in certain taxa, is identifiable within the spacer and accounts for much of the variability. There were several other multiresidue deletion/insertion events in the spacers that define major clades. Based on the indel events and modifications of the 50-bp element it is apparent that the spacer from bloodwood (informal subgenera Blakella and Corymbia) species of Eucalyptus is more similar to that of Angophora than to non-bloodwood species of Eucalyptus. Parsimony analysis showed Eucalyptus to be paraphyletic, with the bloodwoods being more closely related to Angophora than to the rest of Eucalyptus. This finding supports taxonomic revision of Eucalyptus.