レトロウイルスゲノムRNAの二量体化：構造的および機能的意味

レトロウイルスは、多様な病気の起源に広がる小動物ウイルスのファミリーです。それらは、RNAゲノムの逆転写やプロビラルDNAの宿主ゲノムへの統合など、共通の構造的および機能的特性を共有し、二倍体ゲノムをパッケージ化する特異性を持っています。すべてのレトロウイルスのゲノムは、ダイマーリンケージ構造（DLS）と呼ばれる領域で5 '端近くに非共有結合されている2つの相同RNA分子で構成されています。現在、主要なスプライスドナーサイトの上流または下流のいずれかに位置するすべてのレトロウイルスの5 'リーダー領域にある特定のサイト（またはサイト）が二量体の連鎖に関与しているという証拠がかなりあります。Momulv、特にHIV-1の場合、二量体化開始部位（DIS）と呼ばれるステムループ構造で二量体化が開始されることが示されました。他のレトロウイルスのHIV-1および関連領域のDISは、長距離相互作用によってさらに安定することができる典型的なループループ「キス」複合体に関与する、自己補完的なループシーケンスを持つ高度に保存された構造に対応しています。立体構造の再配置。ウイルスRNAダイマーに関与するRNA相互作用は、次のようなレトロウイルスサイクルのいくつかの重要なステップを調節するために仮定されました：i）翻訳やカプシス化：高度に構造化されたDLSエンカプシス化シグナルによって課されるGAG翻訳の停止は、RNAゲノムを利用可能にします。カプシド化機械;ii）逆転写中の組換え：粒子に2つのRNA分子の存在は、ウイルスの子孫の変動性と生存率に必要であり、DLSによって課される順序付けられた構造は効率的な逆転写に必要です。

Retroviruses are a family of widespread small animal viruses at the origin of a diversity of diseases. They share common structural and functional properties such as reverse transcription of their RNA genome and integration of the proviral DNA into the host genome, and have the particularity of packaging a diploid genome. The genome of all retroviruses is composed of two homologous RNA molecules that are non-covalently linked near their 5' end in a region called the dimer linkage structure (DLS). There is now considerable evidence that a specific site (or sites) in the 5' leader region of all retroviruses, located either upstream or/and downstream of the major splice donor site, is involved in the dimer linkage. For MoMuLV and especially HIV-1, it was shown that dimerization is initiated at a stem-loop structure named the dimerization initiation site (DIS). The DIS of HIV-1 and related regions in other retroviruses corresponds to a highly conserved structure with a self-complementary loop sequence, that is involved in a typical loop-loop 'kissing' complex which can be further stabilized by long distance interactions or by conformational rearrangements. RNA interactions involved in the viral RNA dimer were postulated to regulate several key steps in retroviral cycle, such as: i) translation and encapsidation: the arrest of gag translation imposed by the highly structured DLS-encapsidation signal would leave the RNA genome available for the encapsidation machinery; and ii) recombination during reverse transcription: the presence of two RNA molecules in particles would be necessary for variability and viability of virus progeny and the ordered structure imposed by the DLS would be required for efficient reverse transcription.