Hox AおよびHox B Homeobox Gene Clusters機能分析の3 'に位置するレチノイン酸応答性エンハンサー

Homeobox遺伝子は、発達中の脊椎動物胚の空間的アイデンティティと組織の分化を制御します。レチノイドは、HOX遺伝子の調節に関与するシグナル伝達分子です。以前に、DR5レチノイン酸応答要素（まれ）を含むRAIDR5と呼ばれる3 'エンハンサーを特定し、テラトカノーマ細胞におけるマウスHOXA-1遺伝子のレチノイン酸（RA）関連発現の原因でした。DR5レアを含む同様のエンハンサーが、マウスHOXB-1遺伝子のDNase I-Hypersensitive部位3 'にあることを実証します。このエンハンサーであるHOXB-1 RAIDR5は、HOXB-1遺伝子のRA応答性を調節し、以前に記載されたRA制御3 'HOXB-1エンハンサーと位置と配列が異なります。DR5レア、保存された元素（CE）1、およびCE2を含むマウスHOXA-1 RA誘導性RAIDR5エンハンサー内のいくつかのDNA要素は、マウスHOXB-1 RAIDR5エンハンサー、HOXA-1のヒトホモログ、およびHoxa-1、およびチキンHOXB-1遺伝子で。ゲルシフトは、Ce2シーケンスTatttactcaがRA誘導性因子に結合することを示し、UV架橋は170 kDaタンパク質がこの配列に結合することを示しています。したがって、HOXA-1およびHOXB-1遺伝子は、内因性レチノイドに対する発現と応答性が制御される同様の配列を持つ3 'エンハンサーを持っています。

Homeobox genes control the spatial identity and differentiation of tissues in the developing vertebrate embryo. Retinoids are signaling molecules involved in the regulation of Hox genes. We previously identified a 3' enhancer called the RAIDR5, which contained a DR5 retinoic acid response element (RARE) and was responsible for the retinoic acid (RA)-associated expression of the murine Hoxa-1 gene in teratocarcinoma cells. We demonstrate that a similar enhancer, which contains a DR5 RARE, is located at a DNase I-hypersensitive site 3' of the murine Hoxb-1 gene. This enhancer, the Hoxb-1 RAIDR5, regulates the RA responsiveness of the Hoxb-1 gene and is different in location and sequence from the RA-regulated 3' Hoxb-1 enhancers previously described. Several DNA elements within the murine Hoxa-1 RA-inducible RAIDR5 enhancer, including the DR5 RARE, conserved element (CE) 1, and CE2, are conserved in the murine Hoxb-1 RAIDR5 enhancer, the human homolog of Hoxa-1, and in the chicken Hoxb-1 gene. Gel shifts show that the CE2 sequence TATTTACTCA binds an RA-inducible factor, while UV cross-linking indicates that a 170-kDa protein binds to this sequence. Thus, the Hoxa-1 and Hoxb-1 genes possess 3' enhancers with similar sequences through which their expression and responsiveness to endogenous retinoids are controlled.