トマトの実生と成熟した植物における5つのフィトクロム転写産物の絶対的な定量化（Solanum lycopersicum L）

ここで説明するのは、フィトクロム遺伝子（PHY）ファミリーの個々のメンバーから転写されたmRNAの絶対量の最初の定量的測定値です。Phy mRNAの豊富さは、乾燥種子と、緑の家栽培トマト（Solanum lycopersicum L.）の苗と成熟した植物の選択された臓器について決定されました。ホスホイマージャーを使用すると、PHYA、PHYB1、PHYB2、PHYEおよびPHYF転写産物の絶対量を測定して、in vivoで合成されたmRNAフラグメントから調製した標準曲線を参照して測定しました。方法論が開発され、Phyの高度に保存された領域に由来するポリメラーゼ連鎖反応（PCR）生成プローブの使用を許可し、CDNAをクローン化し、3 '非コーディング領域に由来するプローブを分離する必要性を除去しました。乾燥種子では、PHYB1 mRNAは最も豊富であるように見えました（4-5ムモール/mol mRNA）。実生では、PHYB1、PHYB2、PHYE、およびPHYF mRNAはシュートで最も豊富でした（25-87 Mumol/mol mRNA）が、PHYA mRNAは根（325ムモール/mol mRNA）で最も豊富でした。成体植物では、PHYAのレベル。PHYB1とPHYE mRNAは、異なる臓器間で比較的均一でした（それぞれ約100、75、および10ムモール/mol mRNA）。対照的に、PHYB2とPHYFは、熟成果物（それぞれ35および47 Mol mRNA）で優先的に発現しました。一般に、苗木と成熟植物の両方の5つのmRNAの存在量を減少させる順序は、PHYA、PHYB1、PHYE、PHYB2およびPHYFでした。Phy発現の程度の比較的控えめな変化が表現型の変化をもたらすという観察に基づいて、ここで説明する5つのトマトPhyのそれぞれの微分発現は、各フィトクロムの生物活性の空間的発現に影響を与えると予測されています。

Described here are the first quantitative measurements of absolute amounts of mRNAs transcribed from individual members of a phytochrome gene (PHY) family. The abundances of PHY mRNAs were determined for dry seed and for selected organs of green-house-grown tomato (Solanum lycopersicum L.) seedlings and mature plants. With a Phosphoimager, absolute amounts of PHYA, PHYB1, PHYB2, PHYE and PHYF transcripts were measured with reference to standard curves prepared from mRNA fragments synthesized in vivo. Methodology was developed permitting the use of polymerase chain reaction (PCR)-generated probes derived from a highly conserved region of PHY, obviating the necessity to clone cDNAs and to isolate probes derived from their 3' non-coding regions. In dry seeds, PHYB1 mRNA appeared to be most abundant (4-5 mumol/mol mRNA) while in all other instances PHYA mRNA predominated. In seedlings, PHYB1, PHYB2, PHYE, and PHYF mRNAs were most abundant in the shoot (25-87 mumol/mol mRNA) while PHYA mRNA was most abundant in the root (325 mumol/mol mRNA). In adult plants, the levels of PHYA. PHYB1 and PHYE mRNAs were relatively uniform among different organs (approx. 100, 75, and 10 mumol/mol mRNA, respectively). In contrast, PHYB2 and PHYF were expressed preferentially in ripening fruits (35 and 47 mumol/mol mRNA, respectively), indicative of a possible role in fruit ripening for the phytochromes they encode. In general, the order of decreasing abundance of the five mRNAs for both seedlings and mature plants was PHYA, PHYB1, PHYE, PHYB2 and PHYF. Based upon observations that relatively modest changes in the extent of PHY expression result in changes in phenotype, the differential expression of each of the five tomato PHY described here is predicted to impact upon the spatial expression of biological activity of each phytochrome.