微分抽出とタンパク質シーケンスは、植物からの一次細胞壁タンパク質のパターンの大きな違いを明らかにします

シロイヌナズナ、ニンジン、フレンチビーン、トマト、タバコの5つの植物種の懸濁液培養細胞の原発性細胞壁のタンパク質が比較されています。採用されたアプローチは、タンパク質配列決定を促進するために、2次元ゲル分析ではなく、SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動（Page）がそれに続く微分抽出です。細胞全体を、次の水溶液、CACL2、CDTA（シクロヘキサンジアミノテトラ酢酸、DTT（ジチオトレイトール）、NaCl、およびホウ酸塩分析で順次洗浄しました。SDS-PAGE分析は、種間の一貫した違いを示しました。SDS-PAGEは5種すべてで著しく異なります。（ii）これらのタンパク質の多くは、壁タンパク質のかなりの割合が以前に記載されていないことを示すデータベース検索で識別できません。抽出プロセスは、分化の側面が細胞外壁タンパク質の補体に存在するように見える。データは、EST（表現されたシーケンスタグ）およびDNAシーケンス戦略を補完する細胞壁研究のタンパク質リソースを表しています。

The proteins of the primary cell walls of suspension cultured cells of five plant species, Arabidopsis, carrot, French bean, tomato, and tobacco, have been compared. The approach that has been adopted is differential extraction followed by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE), rather than two-dimensional gel analysis, to facilitate protein sequencing. Whole cells were washed sequentially with the following aqueous solutions, CaCl2, CDTA (cyclohexane diaminotetraacetic acid, DTT (dithiothreitol), NaCl, and borate. SDS-PAGE analysis showed consistent differences between species. From the 233 proteins that were selected for sequencing, 63% gave N-terminal data. This analysis shows that (i) patterns of proteins revealed by SDS-PAGE are strikingly different for all five species, (ii) a large number of these proteins cannot be identified by data base searches indicating that a significant proportion of wall proteins have not been previously described, (iii) the major proteins that can be identified belong to very different classes of proteins, (iv) the majority of proteins found in the extracellular growth media are absent from their respective cell wall extracts, and (v) the results of the extraction process are indicative of higher order structure. It appears that aspects of speciation reside in the complement of extracellular wall proteins. The data represent a protein resource for cell wall studies complementary to EST (expressed sequence tag) and DNA sequencing strategies.