翼のあるヘリックスタンパク質のDNA結合特異性が、主要なDNA結合ヘリックスに隣接するアミノ酸配列の構造変化によって媒介されるという証拠

翼のあるヘリックスDNA結合モチーフの結合特異性は、主にDNAとの相互作用に関与する部分であるアルファヘリックス（H3）に隣接する残基によって媒介されるという仮説を支持する最初の構造的証拠を提示します。NMRを使用して、翼のあるヘリックスファミリーメンバーであるGenesis（以前のHFH-2）の二次構造要素を決定し、HNF-3GAMMA/DNA複合体のX線結晶構造に見られるものと比較します[Clark、K。L.、Halay、E. D.、Lai、E。、＆Burley、S。K.（1993）Nature 364、412-420]、観察された主な違いは、H3とその直前に発生することを示しています。創世記のH3はHNF-3GAMMAよりもわずかに短く、さらに、HNF-3GAMMA/DNA複合体には見られないH2とH3の間の領域で、余分な小さなヘリックス（H4）を観察します。これは以前に示されているために重要です[Overdier、D。G.、Porcella、A。、＆Costa R. H.（1994）Mol。細胞。Biol。14、2755-2766] DNA結合特異性は、この領域のアミノ酸残基の影響を受けていること。

We present the first structural evidence supporting the hypothesis that the binding specificity of the winged helix DNA binding motif is mediated by residues adjacent to the alpha-helix (H3), the moiety which is primarily involved in the interaction with DNA. Using NMR to determine secondary structural elements of a winged helix family member, Genesis (formerly HFH-2), and comparing these with those found in the X-ray crystal structure of the HNF-3gamma/DNA complex [Clark, K. L., Halay, E. D., Lai, E., & Burley, S. K. (1993) Nature 364, 412-420], we show that the major differences observed occur for H3 and the region immediately prior to this. H3 in Genesis is slightly shorter than in HNF-3gamma and, in addition, we observe an extra small helix (H4) in the region between H2 and H3 which is not found in the HNF-3gamma/DNA complex. This is significant as it has been shown previously [Overdier, D. G., Porcella, A., & Costa R. H. (1994) Mol. Cell. Biol. 14, 2755-2766] that the DNA-binding specificity is influenced by amino acid residues in this region.