パリンドローム配列を含むDNAの組換えによる修復

ここでは、240 bp染色体逆繰り返し繰り返し（パリンドロミク）シーケンスを維持する大腸菌細胞の生存率には、相同組換え機能が必要であると報告します。野生型細胞は、このパリンドロームを正常に複製できますが、パリンドロームを運ぶReca、Recb、またはRecc変異体は実行不可能です。SBCC変異体では、細胞生存率の相同組換えへの依存が克服されます。パリンドロームを含むDNAの直接繰り返されるコピーは、SBCC変異体ではなく、野生型細胞の単一コピーに急速に解決されます。我々の結果は、SBCCDヌクレアーゼによってパリンドロームDNA配列で導入された二本鎖切断が相同組換えによって修復されることを示唆しています。修復は保守的であり、パリンドロームは修復された染色体に保持されています。SBCCDは二次構造を攻撃できると結論付けていますが、修復はDNA配列を折りたたむ可能性があると節約すると結論付けています。

We report here that homologous recombination functions are required for the viability of Escherichia coli cells maintaining a 240 bp chromosomal inverted repeat (palindromic) sequence. Wild-type cells can successfully replicate this palindrome but recA, recB or recC mutants carrying the palindrome are unviable. The dependence on homologous recombination for cell viability is overcome in sbcC mutants. Directly repeated copies of the DNA containing the palindrome are rapidly resolved to single copies in wild-type cells but not in sbcC mutants. Our results suggest that double-strand breaks introduced at the palindromic DNA sequence by the SbcCD nuclease are repaired by homologous recombination. The repair is conservative and the palindrome is retained in the repaired chromosome. We conclude that SbcCD can attack secondary structures but that repair conserves the DNA sequence with the potential to fold.