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シロイヌナズナシクロフィリン（CYP）遺伝子ファミリーの4人のメンバーを分離し、ROC1からROC4（ロタマーゼCYP）を指定しました。ROC1、2、3の推定されたペプチドは、アブラナナパスサイトゾルCYPと75％から91％同一であり、リーダーペプチドが含まれておらず、哺乳類のサイトゾルCYPと比較して保存された7つのアミノ酸挿入を含みます。他の2つのシロイヌナズナCYP、ROC5（43H1; ATCYP1）とROC6（ATCYP2）は、これらの機能を共有しています。ROC1、ROC2、ROC3、およびROC5は、光成長植物のすべての試験臓器で発現しています。ROC2とROC5は、花で発現の上昇を示しています。ROC1、ROC2、およびROC3の発現は暗闇が減少し、これらの遺伝子は、wouding時に発現がわずかな上昇を示します。推定上のサイトゾルCYP（ROC1、2、3、5、6）をコードする5つのシロイヌナズナ遺伝子には、イントロンが含まれていません。対照的に、葉緑体間質CYPをコードするROC4は、6つのイントロンによって中断されます。ROC4は根で発現しておらず、光によって強く誘導されます。すべての既知のCYPおよびCYP関連タンパク質の系統樹は、原核生物と真核生物の間のCYP遺伝子の水平移動の可能性のある証拠と、真核生物内のこれらのタンパク質のポリフィラティック起源の可能性の証拠を提供します。これらの木は、細胞内局在と構造に基づいて、真核生物CYPの重要なグループ化も示しています。ミトコンドリアCYPは、ソース生物のサイトゾルCYPと密接に関連していますが、小胞体CYPは別々のクレードを形成します。既知の植物CYPは3つのクレードに分類されます。1つは、高植物サイトゾルCYPの大部分を含む1つ、ROC2と関連するライスCYPのみを含むもの、もう1つはクロルプラストCYPのみを含むものです。
シロイヌナズナシクロフィリン（CYP）遺伝子ファミリーの4人のメンバーを分離し、ROC1からROC4（ロタマーゼCYP）を指定しました。ROC1、2、3の推定されたペプチドは、アブラナナパスサイトゾルCYPと75％から91％同一であり、リーダーペプチドが含まれておらず、哺乳類のサイトゾルCYPと比較して保存された7つのアミノ酸挿入を含みます。他の2つのシロイヌナズナCYP、ROC5（43H1; ATCYP1）とROC6（ATCYP2）は、これらの機能を共有しています。ROC1、ROC2、ROC3、およびROC5は、光成長植物のすべての試験臓器で発現しています。ROC2とROC5は、花で発現の上昇を示しています。ROC1、ROC2、およびROC3の発現は暗闇が減少し、これらの遺伝子は、wouding時に発現がわずかな上昇を示します。推定上のサイトゾルCYP（ROC1、2、3、5、6）をコードする5つのシロイヌナズナ遺伝子には、イントロンが含まれていません。対照的に、葉緑体間質CYPをコードするROC4は、6つのイントロンによって中断されます。ROC4は根で発現しておらず、光によって強く誘導されます。すべての既知のCYPおよびCYP関連タンパク質の系統樹は、原核生物と真核生物の間のCYP遺伝子の水平移動の可能性のある証拠と、真核生物内のこれらのタンパク質のポリフィラティック起源の可能性の証拠を提供します。これらの木は、細胞内局在と構造に基づいて、真核生物CYPの重要なグループ化も示しています。ミトコンドリアCYPは、ソース生物のサイトゾルCYPと密接に関連していますが、小胞体CYPは別々のクレードを形成します。既知の植物CYPは3つのクレードに分類されます。1つは、高植物サイトゾルCYPの大部分を含む1つ、ROC2と関連するライスCYPのみを含むもの、もう1つはクロルプラストCYPのみを含むものです。
We have isolated four members of the Arabidopsis cyclophilin (CyP) gene family, designated ROC1 to ROC4 (rotamase CyP). Deduced peptides of ROC1, 2 and 3 are 75% to 91% identical to Brassica napus cytosolic CyP, contain no leader peptides and include a conserved seven amino-acid insertion relative to mammalian cytosolic CyPs. Two other Arabidopsis CyPs, ROC5 (43H1; ATCYP1) and ROC6 (ATCYP2), share these features. ROC1, ROC2, ROC3 and ROC5 are expressed in all tested organs of light-grown plants. ROC2 and ROC5 show elevated expression in flowers. Expression of ROC1, ROC2, and ROC3 decreases in darkness and these genes also exhibit small elevations in expression upon wouding. The five Arabidopsis genes encoding putative cytosolic CyPs (ROC1, 2, 3, 5 and 6) contain no introns. In contrast, ROC4, which encodes a chloroplast stromal CyP, is interrupted by six introns. ROC4 is not expressed in roots, and is strongly induced by light. Phylogenetic trees of all known CyPs and CyP-related proteins provide evidence of possible horizontal transfer of CyP genes between prokaryotes and eukaryotes and of a possible polyphyletic origin of these proteins within eukaryotes. These trees also show significant grouping of eukaryotic CyPs on the basis of subcellular localization and structure. Mitochondrial CyPs are closely related to cytosolic CyPs of the source organism, but endoplasmic reticulum CyPs form separate clades. Known plant CyPs fall into three clades, one including the majority of higher-plant cytosolic CyPs, one including only ROC2 and a related rice CyP, and one including only chlorplast CyPs.
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