核核生物における転写調節における転写制御とサイレンサーの役割

転写とその調節を制御するメカニズムは、分子生物学、そして最終的には細胞生物学の理解に基づいています。転写の開始とRNAポリメラーゼなどの不可欠な因子に関する私たちの知識はかなりのものであり、最近ではエンハンサーやホロ酵素やメディエーターなどの複合体の関与についての理解が劇的に増加しています。ただし、転写抑制の理解は、プロモーター構造と遺伝子発現の調節を完全に理解するためにも不可欠です。真核生物の転写抑制は、「サイレンサー」によって達成されます。「サイレンサー」は、「サイレンサー要素」と「負の調節要素」（nRE）の2つのタイプがあります。サイレンサー要素は、アクティブな抑制メカニズムを指示する古典的な位置に依存しない要素であり、NREは受動的抑制メカニズムを指示する位置依存要素です。さらに、「リプレッサー」は、サイレンサーと直接相互作用するDNA結合トラスクリプション因子です。最近の文献のレビューは、抑制のメカニズムを決定する相互作用するリプレッサーではなく、それが特定のプロモーター内のサイレンサー自体とそのコンテキストであることを明らかにしています。サイレンサーは多くの真核生物プロモーターの本質的な部分を形成し、その結果、真核生物の遺伝子調節を理解するためには、エンチャンサーや他の転写要素との相互作用的な役割に関する知識が不可欠です。

Mechanisms controlling transcription and its regulation are fundamental to our understanding of molecular biology and, ultimately, cellular biology. Our knowledge of transcription initiation and integral factors such as RNA polymerase is considerable, and more recently our understanding of the involvement of enhancers and complexes such as holoenzyme and mediator has increased dramatically. However, an understanding of transcriptional repression is also essential for a complete understanding of promoter structure and the regulation of gene expression. Transcriptional repression in eukaryotes is achieved through 'silencers', of which there are two types, namely 'silencer elements' and 'negative regulatory elements' (NREs). Silencer elements are classical, position-independent elements that direct an active repression mechanism, and NREs are position-dependent elements that direct a passive repression mechanism. In addition, 'repressors' are DNA-binding trasncription factors that interact directly with silencers. A review of the recent literature reveals that it is the silencer itself and its context within a given promoter, rather than the interacting repressor, that determines the mechanism of repression. Silencers form an intrinsic part of many eukaryotic promoters and, consequently, knowledge of their interactive role with enchancers and other transcriptional elements is essential for our understanding of gene regulation in eukaryotes.